针对基本农田种树的违法行为，处理方式及法律依据主要如下：
一、明确结论
在基本农田上种树是明确的违法行为，必须依法进行处理，以维护国家粮食安全和农业可持续发展。
二、政策法规依据
- 《中华人民共和国土地管理法》：该法明确规定了土地的使用和管理，禁止占用永久基本农田发展林果业，包括种植树木。
- 《基本农田保护条例》第十七条：进一步强调了禁止在基本农田保护区内进行破坏基本农田的活动，如种树等。
三、处理措施
责令改正与移除树木：
- 由县级以上人民政府自然资源主管部门或农业农村主管部门责令当事人立即停止违法行为。
- 限期将种在基本农田上的树木全部移除，并对土地进行必要的整治，如翻耕、施肥等，以恢复耕种条件。
法律处罚：
- 罚款：虽然具体罚款幅度可能因地区而异，但违法者可能面临罚款处罚，具体金额由相关部门根据实际情况裁定。
- 追究刑事责任：若违法行为情节严重，造成基本农田大量毁坏，并达到刑事立案标准，将依法追究当事人的刑事责任。这可能包括非法占用农用地罪等。
影响补贴政策：
- 在一些地区，若农户在基本农田种树，可能会影响其享有的耕地地力保护补贴等相关农业补贴政策。相关部门将停止发放补贴，直至基本农田恢复正常耕种用途。
其他行政处罚：
- 在某些情况下，若违法行为特别严重或造成严重后果，相关执法部门可能对违法者采取吊销相关证照、暂停或取消相关资格等其他行政处罚措施。
四、法律遵循与配合整改
在处理过程中，违法者必须严格遵守相关法律法规，主动接受相关部门的处罚，并积极配合政府的工作进行整改。通过积极的整改态度和行动，有可能减轻所面临的法律责任。
五、加强宣传教育与预防
为了防止类似问题的再次发生，政府和社会各界应加强对基本农田保护的宣传教育力度，提高公众对基本农田重要性的认识和重视程度。同时，应建立健全监管机制，加强对基本农田的巡查和监管，及时发现并制止违法行为。
综上所述，对于在基本农田上种树的违法行为，必须采取果断措施进行整改和处罚。同时，也提醒广大农民和土地使用者务必遵守相关法律法规，不得擅自改变基本农田的用途。