员工违反规章制度，用人单位在遵循法律规定的前提下，可以合理扣除工资。但这一扣除行为必须合法、合规，且不得损害员工的合法权益。以下是对此问题的详细解答：
一、合法扣工资的情形
规章制度明确规定：
- 用人单位需依法制定规章制度，并明确其中员工违规行为对应的扣薪情形和标准。
- 规章制度的制定应经过民主程序，如职工代表大会讨论通过，并已向员工公示告知。
- 当员工出现相应违规行为时，用人单位可按照规章制度的规定扣工资。
劳动合同有约定：
- 若劳动合同中明确约定了员工违规行为导致扣薪的具体条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，则用人单位可按约定执行扣薪。
给单位造成经济损失：
- 若员工因本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可要求员工赔偿，并从其工资中扣除，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%。
- 扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
二、非法扣工资的情形
缺乏明确依据：
- 若用人单位无明确的规章制度依据或劳动合同约定，随意以员工违规为由扣工资，则为不合法行为。
扣除金额不合理：
- 即使存在扣工资的情形，但若扣除金额过高或明显不合理，如超出员工当月工资的20%或扣除后剩余工资低于当地最低工资标准，也可能被认定为违法。
无故扣除工资：
- 用人单位无故扣除劳动者工资，或扣除理由不符合上述合法情形，均属违法行为。
三、劳动者维权途径
若员工认为用人单位的扣工资行为不合法，可通过以下途径进行维权：
协商解决：
- 首先可与用人单位进行协商解决，尝试通过沟通达成共识。
投诉与仲裁：
- 协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉，或向劳动仲裁委员会申请仲裁。
- 投诉或申请仲裁时，需提供相关证据以证明用人单位的扣工资行为不合法。
诉讼：
- 对劳动仲裁委员会的裁决结果不服时，可向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
综上所述，员工违反规章制度时，用人单位在合法、合理的范围内可以进行薪资扣除，但必须确保扣除行为符合法律法规的规定，并建立健全的规章制度以明确告知员工相关规定。同时，员工也应了解自己的权益，如遇非法扣工资情况，应及时采取合法途径进行维权。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。