员工自动离职，公司不可以随意扣工资。具体分析如下：
法律原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
可以扣除工资的情形及限制：
- 法定情形：根据《工资支付暂行规定》，只有在特定情形下，如代扣代缴的个人所得税、社会保险费用等，用人单位才可以代扣劳动者工资。
- 因员工自动离职造成的损失：如果员工自动离职给公司造成了经济损失，且公司能够提供充分证据，那么公司有权从员工应得工资中扣除相应的赔偿金额。但这种扣除必须基于实际损失，且不得超过劳动者当月工资的20%，同时扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
注意事项：
- 公司在扣除工资前，必须收集并保留充分的证据来证明员工的自动离职行为以及因此造成的损失。
- 公司应与员工进行充分沟通，解释扣除的原因和依据，并听取员工的意见和申辩。
综上所述，员工自动离职时，公司不可以随意扣工资。只有在员工自动离职给公司造成实际损失，且公司能够提供充分证据的情况下，才可以按照法律规定扣除相应工资。如果公司擅自扣工资，员工可以通过劳动仲裁等途径维护自身权益。