国企职工病假住院期间扣发工资不合理，但具体需根据法律规定和单位规章制度来判断。

1. 法律规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者在患病或非因工负伤时，有权获得医疗期内的病假待遇。医疗期根据劳动者实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
   • 在此期间，用人单位应按有关规定支付病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。

2. 单位规章制度：

   • 国企在制定病假工资支付规定时，应遵守国家法律法规，确保病假工资支付标准不低于法律规定的最低标准。
   • 如果国企的规章制度中规定了更高的病假工资支付标准，则应按照规章制度执行。

3. 实际情况分析：

   • 如果国企职工在病假住院期间，单位按照法律规定或更高的标准支付了病假工资，那么扣发工资就是不合理的。
   • 如果单位未按规定支付病假工资，或者扣发的工资超过了法律允许的范围，那么职工有权向单位提出异议，并要求单位按照法律规定支付病假工资。

4. 建议：

   • 国企职工在病假住院期间，应了解自己的合法权益，包括病假工资的支付标准和医疗期的相关规定。
   • 如果发现单位扣发工资不合理，应首先与单位进行协商解决。协商不成时，可以向当地的劳动保障监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等方式维护自己的合法权益。

综上所述，国企职工病假住院期间扣发工资是否合理，主要取决于单位是否按照法律法规的规定支付了病假工资。如果单位未按规定支付，职工有权采取合法途径维护自己的权益。