针对您提出的问题，“有案底的人是否可以办理港澳通行证商务签证”，首先我们需要明确“案底”通常指的是一个人过去的犯罪记录或不良记录。接下来，我们结合您提供的参考信息来详细分析这个问题。

根据参考信息中关于“什么样的人不能办理出入境通行证”的描述，我们可以总结出以下几类不能办理出入境通行证的情况：

1. 不具有中华人民共和国国籍的；
2. 无法证明身份的；
3. 在申请过程中弄虚作假的；
4. 被判处刑罚正在服刑的；
5. 有未了结的民事案件且被人民法院通知不能出境的；
6. 属于刑事案件被告人或者犯罪嫌疑人的；
7. 出境后可能对国家安全造成危害或者对国家利益造成重大损失的；
8. 因妨害国（边）境管理受到刑事处罚或者因非法出境、非法居留、非法就业被遣返回国的；
9. 法律、行政法规规定不准出境的其他情形。

在这些情况中，与“案底”直接相关的是第8点，即因妨害国（边）境管理受到刑事处罚或者因非法出境、非法居留、非法就业被遣返回国的，这类人不能办理出入境通行证。然而，对于其他类型的犯罪记录或不良记录（如非妨害国（边）境管理的刑事犯罪），并未直接列为不能办理出入境通行证的情形。

进一步来说，港澳通行证商务签证的办理除了需要满足基本的出入境证件办理条件外，还可能涉及特定的商务活动要求。因此，对于有“案底”的人来说，能否办理港澳通行证商务签证，还需要考虑其犯罪记录的具体性质、严重程度以及是否会对商务活动或国家安全造成潜在威胁。

综上所述，有“案底”的人并不一定不能办理港澳通行证商务签证，但需要具体情况具体分析。建议这类人群在申请前咨询当地的出入境管理部门或相关律师，以获取更准确的指导和帮助。同时，也需要注意，即使能够办理，也可能需要额外的审核和证明材料。