您好，关于有案底是否能办理港澳通行证的问题，这主要取决于您的案底性质以及当前的法律状态。

首先，根据相关规定，如果存在以下情形，是不予签发出入境通行证的：

1. 不具有中华人民共和国国籍；
2. 无法证明身份；
3. 在申请过程中弄虚作假；
4. 被判处刑罚正在服刑；
5. 人民法院通知有未了结的民事案件不能出境；
6. 属于刑事案件被告人或者犯罪嫌疑人；
7. 国务院有关主管部门认为出境后将对国家安全造成危害或者对国家利益造成重大损失；
8. 因妨害国（边）境管理受到刑事处罚或者因非法出境、非法居留、非法就业被遣返回国；
9. 法律、行政法规规定不准出境的其他情形。

特别需要注意的是，如果您目前正在服刑或者涉及未了结的刑事案件，那么您是无法办理港澳通行证的。然而，如果您的案底是已经处理完毕的刑事案件，并且您已经服刑完毕或者得到了法律的宽恕，那么理论上您是有资格申请港澳通行证的。但具体能否成功办理，还需要看当地出入境管理部门的审核结果。

另外，为了方便您办理港澳通行证，建议您提前通过微信小程序“移民局”或支付宝进行预约，并按照页面提示填写个人信息、选择办证类型和填写办证信息。这样可以帮助您更快、更高效地完成办证流程。

总的来说，有案底并不一定会影响您办理港澳通行证，但具体能否办理还需要根据您的案底性质和当前法律状态来判断。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请咨询当地出入境管理部门或专业律师。