在购买第二套房子并办理房产证时，确实涉及到一些税费问题，以下是对相关税费及费用的详细解答：

一、契税

契税是购买第二套房时主要需要缴纳的税种。其税率根据房屋面积和购买者的房产情况来确定：

1. 如果房屋面积小于等于90平方米：

   • 若购买者家庭名下无房但有贷款记录，或者已经拥有一套住房，契税税率为1%。例如，购买200万元的房子，应缴契税就是2万元。但需要注意的是，像北京、上海、广州、深圳等特定城市可能不享受这个优惠，二套房的契税税率一般为3%。

2. 如果房屋面积大于90平方米但小于144平方米：

   • 若购买者家庭名下已经拥有一套住房，契税税率为2%。例如，购买300万元的房子，应缴契税就是6万元。

3. 对于非普通住宅或者家庭名下已有两套及以上住房的情况：

   • 契税税率为4%。

二、其他税种

1. 个人所得税：这主要是针对二手房交易中的卖方征收的，税率为交易总额的1%或两次交易差的20%。如果所售房产是家庭唯一住房且已经持有五年以上，可以免征个人所得税。这个税种通常由卖方承担，买方在办理房产证时不需要缴纳。

2. 增值税及附加：对于非普通住宅，如果产权未满两年，需要缴纳全额的5.6%作为税费；如果已满两年，则可以免征。对于普通住宅，如果产权未满两年，需要按差额的5.6%缴纳；如果已满两年，同样可以免征。这个税种也通常由卖方承担。

三、其他费用

1. 印花税：虽然通常按交易总额的0.05%缴纳，但从2009年开始，国家已经暂免征收住宅印花税。

2. 登记费：住宅登记费一般为80元/套，非住宅则为550元/套。

3. 交易手续费：新建商品房的交易手续费通常为3元/平方米，而二手房因为已经完成首次产权登记，所以在后续的交易中不再需要缴纳这个费用。非住宅类的交易费用可能会相对较高。

综上所述，在购买第二套房子并办理房产证时，契税是主要的税种，其具体税率需要根据房屋的实际情况和当地的税收政策来确定。而其他如个人所得税、增值税及附加等通常由卖方承担。此外，还需要注意可能的登记费、交易手续费等其他费用。建议在购房前咨询当地的税务部门或专业的房地产律师，以获取准确的税费信息和计算方式，确保购房过程的顺利进行。