政府收回房屋免征增值税的具体操作，主要依据的是《中华人民共和国土地增值税暂行条例》及其相关实施细则，以及特定的地方性税务公告，如上海市地方税务局发布的相关公告。以下是对这一问题的详细解答：

一、免征增值税的法律依据

• 主要法规：根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》及其实施细则，因国家建设需要依法征收、收回的房地产，可以免征土地增值税。
• 具体文件：如上海市地方税务局发布的《关于纳税人因国家建设需要依法征收收回房地产取得的收入免征土地增值税操作规程的公告》（上海市地方税务局公告2011年第3号），对免征土地增值税的具体操作流程进行了规范。

二、免征增值税的申请条件

• 申请人资格：在本市范围内转让国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物并取得收入的单位和个人，凡符合因国家建设需要依法征收、收回房地产免征土地增值税情形的，均可申请。
• 必要资料：
  1. 免征土地增值税申请表；
  2. 房屋产权证明、土地使用权证明复印件；
  3. 政府有关部门出具的城市实施规划、国家建设需要、政府依法征收或收回的批文原件及复印件；
  4. 与有关部门签订的补偿合同（协议）复印件；转让的房地产转让合同（协议）复印件；
  5. 取得补偿或转让收入的凭证复印件。

三、申请流程

• 申请地点：在本市办理税务登记的纳税人，应向其主管税务机关提出申请；不需要在本市办理税务登记的纳税人，应向房地产所在地区县税务机关提出申请。
• 审批时限：提交资料齐全的，主管税务机关受理后，从受理之日起30个工作日内作出审批决定。

四、注意事项

• 政策变动：税务政策可能会根据时间、地区或特定情况发生变化，因此建议在申请前咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保信息的准确性和时效性。
• 资料完整性：申请免征增值税时，务必确保提交的资料完整、准确，以避免因资料不全或错误而导致的审批延误或失败。

综上所述，政府收回房屋免征增值税是一项具体的税务优惠政策，其申请和审批流程需遵循相关法规和公告的规定。在申请前，建议详细了解相关政策和流程，并咨询当地税务机关或专业税务顾问以获取准确的信息和指导。