公司在有负债的情况下是可以变更股东的。但这一过程需严格遵循相关法律法规和公司章程的规定，确保变更的合法性和合规性，同时妥善处理相关的债务问题。
详细分析
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》等相关法律法规，公司股东的变更本质上是股权的转让，而股权转让在公司存在债权债务时并未被法律明确禁止。
- 《中华人民共和国公司登记管理条例》第三十四条也规定，有限责任公司变更股东的，应当自变更之日起30日内申请变更登记，并提交新股东的主体资格证明或者自然人身份证明。
股东变更的注意事项：
- 内部决策程序：股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意，并遵循公司章程规定的程序。
- 债权债务承担：股东的变更一般不影响公司债权债务的承担主体。公司作为独立的法人，以其全部财产对公司的债务承担责任。新股东在受让股权后，对于其受让前公司的债务，通常仅在其受让的股权范围内承担责任。
- 特殊债务考虑：如果公司的债务涉及银行贷款等特殊债务，变更股权前可能需要征得债权人的同意，以避免触发债务合同中的违约条款。
变更程序：
- 公司应当依法通知债权人并在合理期限内进行公告，以保障债权人的合法权益。
- 变更股东需到工商行政管理部门等相关机构办理相应的变更登记手续。
法律建议
- 在进行股东变更时，公司应咨询专业的律师或会计师，以确保整个过程的合法性和合规性。
- 确保内部决策程序的合法性，妥善处理债权债务问题，并及时完成相关登记手续。
- 如涉及特殊债务，如银行贷款等，应事先与债权人沟通并取得其同意。
通过遵循上述法律建议，公司可以有效规避潜在的法律风险，确保股东变更过程的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。