村民自建房办理不动产证的流程会因地区和时间的不同而有所差异。以下是一个基于您提供的参考信息整理的、较为通用的村民自建房办理不动产证的流程指南：

一、准备必要材料

对于2009年12月31日前修建的老、旧房屋，您需要准备以下材料：

1. 身份证、常住人口登记卡（验原件收复印件1份）。
2. 集体土地建设用地使用证（原件）或其他能证明相关权属来源依据的材料，如土地登记审批表、地籍调查表（需加盖不动产登记中心资料查询专用章）复印件，或农村集体（个人）建设用地批准书。
3. 联合审批表（需所在村民委员会、国土所、乡镇人民政府盖章）、登记发证申请书（这两张表通常在乡镇国土所领取）。
4. 不动产权籍调查表（由乡镇国土所现场测量后出具）。

对于2010年后修建的房屋，您需要准备的材料可能包括：

1. 身份证、常住人口登记卡（验原件收复印件）。
2. 乡村建设规划许可证（原件），通常在乡镇政府规环办办理。
3. 集体土地建设用地批准书或农村宅基地批准书（原件），在乡镇政府经法办办理。
4. 农村宅基地和建房（规划许可）验收意见表（原件），房屋竣工后由各乡、镇人民政府及国土所联合验收并加盖公章。
5. 同一经济组织成员证明（原件），需房屋所在房屋所属组长签字后加盖的村民委员及乡镇人民政府公章。
6. 同样需要不动产权籍调查表（由乡镇国土所现场测量后出具）。

二、提交申请与公示

1. 携带准备好的所有材料到乡镇（街道）国土所申请。
2. 国土所将审核您的材料，并将其涉及的土地房屋信息填写到相关公告中，张贴到村委会或乡政府公示栏进行公示。
   • 对于2009年前的老、旧房屋，公示期为30日；
   • 对于2010年后的房屋，公示期通常为15个工作日。

三、办理不动产证

1. 公示期满且无异议后，您可以携带身份证和户口簿到乡镇国土所申请办理不动产证。
2. 国土所将进一步处理您的申请，并最终颁发不动产证。

四、注意事项

• 初始登记的房屋须满足同村同组农村户口、一户一宅的原则方可申请办理，继承除外。
• 办理过程中可能需要支付一定的费用，如证书工本费等（具体费用标准可能因地区而异）。

请根据您所在地区的具体规定和实际情况，按照上述流程逐步办理。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请咨询当地国土所或相关部门。