未经许可从事旅行社业务是一种违法行为，根据《中华人民共和国旅游法》的相关规定，将会受到相应的处罚，其中包括没收违法所得。关于违法所得的计算，虽然具体的计算方式在法律条文中并没有详细列出，但通常可以根据以下原则和方法进行：

违法所得的计算原则：

1. 直接收入：违法所得首先应包括从事未经许可的旅行社业务所直接获得的全部收入，如服务费、团费、导游费、门票差价等。

2. 扣除成本：在计算违法所得时，通常会考虑扣除与违法行为直接相关的合理成本支出。但这里的成本应仅限于与非法业务直接相关的、且是合法、合理的支出。例如，如果为了开展非法旅行社业务而租赁了办公场地或购买了办公设备，这些费用在理论上可以从总收入中扣除。但需要注意的是，这种扣除并不是绝对的，具体还需根据执法部门的判断和实际情况来确定。

3. 净收益：扣除成本后的净收益即为违法所得。如果违法行为没有产生净收益，或者净收益很少，那么处罚时可能会更多地考虑其他因素，如违法行为的性质、情节、社会危害程度等。

违法所得的计算方法：

1. 总收入核实：首先，执法部门会对违法行为人的总收入进行核实，包括查阅相关账目、收据、银行流水等，以确保数据的真实性和准确性。

2. 成本评估：接着，执法部门会对与违法行为直接相关的成本进行评估。这一过程中，可能会需要违法行为人提供相关的成本证明和计算依据。

3. 计算净收益：在核实总收入和评估成本的基础上，执法部门会计算出违法所得的净收益，并据此作出相应的处罚决定。

注意事项：

• 在计算违法所得时，应确保数据的真实性和准确性，避免虚假申报或隐瞒收入。
• 执法部门在计算违法所得时具有一定的裁量权，因此具体计算结果可能会因案件情况而异。
• 如果对计算结果有异议，违法行为人有权进行申辩和提出异议，并可以请求执法部门提供详细的计算依据和说明。

综上所述，未经许可从事旅行社业务中的违法所得计算是一个相对复杂的过程，需要综合考虑多种因素。在实际操作中，建议违法行为人积极配合执法部门的调查工作，提供真实、准确的数据和资料，以便执法部门能够公正、合理地计算出违法所得，并据此作出相应的处罚决定。