针对你提出的问题“在法院已达成调解协议后，工厂注册资金乙方可不可以减少注册资金”，我的回答如下：

不可以随意减少注册资金。下面我将从几个方面进行详细解释：

1. 公司注册资金的法律意义：

   • 注册资金是公司设立时股东认缴的出资额，它代表了公司的资本实力，也是公司对外承担债务责任的基础。
   • 注册资金一旦确定并登记在册，就不得随意变更，除非经过严格的法定程序。

2. 调解协议与注册资金的关系：

   • 调解协议是双方当事人在法院主持下就争议事项达成的和解协议，它主要解决的是双方之间的债权债务关系或其他争议事项。
   • 调解协议并不直接涉及公司注册资金的变更问题。即使双方达成了调解协议，也不能作为减少注册资金的依据。

3. 减少注册资金的法定程序：

   • 如果公司确实需要减少注册资金，必须按照《公司法》等相关法律法规的规定，履行严格的法定程序，包括召开股东会、形成减资决议、通知债权人、进行公告等。
   • 在减资过程中，公司还需要确保减资后的注册资本不低于法定的最低限额，并且不会损害债权人的利益。

4. 法律后果：

   • 如果公司未经法定程序擅自减少注册资金，将可能面临法律制裁，包括被责令改正、罚款、甚至被吊销营业执照等。
   • 同时，如果减资行为损害了债权人的利益，公司还需要承担相应的赔偿责任。

综上所述，即使在法院已达成调解协议的情况下，工厂注册资金乙方也不可以随意减少注册资金。如果需要减少注册资金，必须按照法定程序进行，并确保不违反相关法律法规的规定。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。