关于“协商解劳动合同协议书上单独约定的工资是应发还是实发”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

结论前置：

协商解除劳动合同协议书上单独约定的工资，通常应理解为应发工资，但具体还需根据协议书的具体内容和双方的真实意图来确定。

分析说明：

1. 应发工资与实发工资的区别：

   • 应发工资：是指劳动者在提供正常劳动情况下，用人单位应当支付给劳动者的工资报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。
   • 实发工资：是在应发工资的基础上，扣除了个人所得税、社会保险费、住房公积金等个人应缴纳部分后的实际到手工资。

2. 协议书的约定：

   • 在协商解除劳动合同协议书中，如果双方明确约定了工资数额，且未特别指明是实发工资，那么一般应理解为应发工资。因为应发工资是劳动者提供劳动后应得的全部报酬，而实发工资则是扣除了各项费用后的实际收入。
   • 如果协议书中明确约定了是实发工资，或者通过上下文可以推断出双方的真实意图是约定实发工资，那么则应按照实发工资来理解。

3. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者可以协商解除劳动合同，并就工资、经济补偿等事项达成协议。但法律并未明确规定协议书中约定的工资是应发还是实发，因此需要根据协议书的具体内容和双方的真实意图来确定。

4. 实际操作建议：

   • 在签订协商解除劳动合同协议书时，双方应明确约定工资的具体数额和性质（应发或实发），以避免后续产生争议。
   • 如果协议书中未明确约定，或者双方对约定存在争议，建议通过沟通、协商或者法律途径来明确双方的权利和义务。

综上所述，协商解除劳动合同协议书上单独约定的工资，通常应理解为应发工资。但具体还需根据协议书的具体内容和双方的真实意图来确定。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师进行解答和处理。