针对您提出的“车辆违章扣了两次怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，您需要确认这两次违章的具体情况，包括违章时间、地点、违章行为以及罚款金额等。这可以通过查询交通违法记录或收到违章通知来获取相关信息。

接下来，根据您的违章情况，您可以选择以下两种主要方式进行处理：

一、执法站窗口处理

1. 携带本人驾驶证、身份证和车辆行驶证原件，前往全市任意交通支、大队执法站接受处理。
2. 在执法站，您可以查看违章视频或照片，确认违章事实。
3. 接受处理后，您会收到交通管理部门开具的行政处罚决定书。
4. 在收到决定书后的十五日内，您需要到指定的银行（如工商银行等）缴纳罚款。若逾期未缴纳，将每日按罚款金额的百分之三加处罚款，但加处罚款总额不超过罚款数额。

二、自助处理（推荐使用“交管12123”APP）

1. 若您已在“交管12123”APP完成注册并成功备案车辆，则可通过该APP处理车辆违章及缴纳罚款。
2. 在APP中选择“违法处理”或“罚款缴纳”功能，按照提示操作即可。
3. 支付成功后，相应的记分也会记入到您的驾驶证中。目前，系统支持微信、支付宝、云闪付等多种支付方式。

此外，如果您对违章认定有异议，可以通过“交管12123”APP的“交通违法消除申请”功能在线提出，或者前往违法行为发生地的交通支、大队执法站提出申诉。

最后，需要提醒您的是，请务必在规定的时限内处理违章并缴纳罚款，以免产生不必要的滞纳金或其他法律后果。同时，也建议您遵守交通规则，安全驾驶，避免再次发生违章行为。