药店连锁总部倒闭后，加盟店的处理方式主要依赖于加盟合同的具体条款以及相关的法律法规。以下是我根据常见情况给出的建议：

1. 检查加盟合同：

   • 首先，加盟店应仔细审查与连锁总部签订的加盟合同。合同中通常会包含关于总部倒闭或解除合同时双方权利与义务的条款。
   • 如果合同中明确规定了总部倒闭时的处理方式，如退还加盟费、转让经营权等，加盟店应按照合同条款执行。

2. 与总部协商：

   • 在合同没有明确规定或规定不明确的情况下，加盟店应尽快与总部或其主要负责人取得联系，协商解决方案。
   • 可以尝试谈判关于剩余加盟期限的退款、库存商品的处理、品牌使用权的延续或转让等问题。

3. 寻求法律援助：

   • 如果协商无果，加盟店可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
   • 可以咨询像我这样的专业律师，了解具体的法律救济措施，如起诉总部违约、要求赔偿损失等。

4. 考虑独立经营或转加盟：

   • 在某些情况下，加盟店可能需要考虑独立经营或转加盟到其他连锁药店品牌。
   • 这需要评估自身的经营能力、市场状况以及新加盟品牌的信誉和实力。

5. 处理善后事宜：

   • 无论采取何种方式，加盟店都需要妥善处理善后事宜，如员工安置、客户通知、供应商结算等。
   • 确保所有事务的合法性和合规性，避免引发新的法律纠纷。

总之，药店连锁总部倒闭对加盟店来说是一个复杂的问题，需要综合考虑多个方面。加盟店应依据加盟合同和相关法律法规，积极与总部协商，并在必要时寻求法律援助，以维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。