灵活就业盖章确实会进行核实。为了确保灵活就业社会保险补贴政策的准确落实，防止虚假申报和骗取补贴资金的行为，相关部门会对申请人的灵活就业情况进行严格的核实。

核实工作通常包括多个环节，如申请人提交材料的审查、实地考察、照相取证等。具体来说，申请人需要持相关材料到所在村（居）、社区进行申请，并填写相应的申请表。然后，由镇（街道）及村（居）、社区指定工作人员对申请人的灵活就业情况和资料真实性进行核实，包括申请人的就业登记、工商登记、社保缴费等情况的审查。这一过程中，可能会通过上门服务、实地检查的方式，与雇主详细沟通，核查灵活就业时间、工作内容、工资薪酬等，以确保审核结果的真实性、准确性。

如果申请人提交的材料不齐全或不符合要求，或者核实过程中发现申请人存在不符合补贴条件的情况，如未实现灵活就业、已实现灵活就业但未进行就业登记、持有各类营业执照、与各类用人单位建立劳动关系等，相关部门将不予补贴，并在申请表上注明原因，告知申请人，并将资料退回申请人。

因此，申请人在申请灵活就业社会保险补贴时，应如实提供相关资料和信息，并配合相关部门的核实工作。同时，也应注意了解相关政策和规定，确保自己符合补贴条件，避免不必要的麻烦和损失。