针对您提出的问题，关于建设工程未通过消防验收而擅自投入使用的处罚措施，我可以为您提供以下详细解答：

首先，根据《中华人民共和国消防法》（1998年通过，2008年修订）的相关规定，对于依法应当进行消防验收的建设工程，如果未经消防验收或者消防验收不合格就擅自投入使用，是违反法律的行为。对此，市住房和城乡建设局作为责任主体，将依法进行处罚。

具体的处罚流程如下：

1. 立案阶段：在检查中发现或者接到举报的此类违法行为后，市住房和城乡建设局将进行审查，并决定是否立案处理。

2. 调查阶段：对于立案的案件，执法人员（不少于两人）将进行调查。在调查过程中，执法人员会出示执法证件，允许当事人进行辩解陈述，并确保保守相关秘密。

3. 审查阶段：在调查结束后，会对违法嫌疑人的基本情况、案件事实、证据、案件定性、法律适用以及办案程序等方面进行全面审查，并提出处理意见。

4. 告知阶段：在作出行政处罚决定之前，会告知违法嫌疑人拟作出的行政处罚决定的事实、理由及依据，并明确告知其依法享有的陈述权和申辩权。

5. 决定阶段：根据审查结果，将制作行政处罚决定书。该决定书会详细载明违法事实和证据、处罚依据和内容，以及申请行政复议或提起行政诉讼的途径和期限等。

6. 送达阶段：行政处罚决定书将当场交付给被处罚人。如果被处罚人拒收，将在处罚决定书上注明，并视为已送达。如果被处罚人不在场，将按照相关规定进行送达。

7. 执行阶段：依据已生效的行政处罚决定书执行相应的处罚措施，如罚款等。对于逾期不履行行政处罚决定的，将采取加罚、申请人民法院强制执行等措施。

具体的处罚措施是：责令停止施工、停止使用或者停产停业，并处以三万元以上三十万元以下的罚款。这一规定旨在确保建设工程的安全性，防止因未经消防验收而擅自投入使用可能引发的安全隐患和事故。

希望以上解答能够为您提供清晰、详细且有深度的信息。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。