原件和复印件的公章区别主要在于它们的法律效力、真实性和使用场景。

首先，从法律效力上来看，原件上的公章具有最直接和最高的法律效力。原件是指经双方当事人合议一致后签字或加盖双方印章的合同文本，它作为合同法规定的“书面形式”中最具有法律证明力的一种，可以被法院直接采信。而复印件，包括扫描件和传真件等，虽然也具有一定的法律效力，但其证明力相对较低。复印件在性质上属于效力待定的证据，不能单独作为认定案件事实的证据，通常需要与其他证据相结合，形成证据链条，才能具有较高的证明效力。

其次，从真实性上来看，原件上的公章更加真实可靠。原件上的公章是直接加盖在合同文本上的，未经过任何复制或转换过程，因此其真实性更容易得到确认。而复印件上的公章则是通过复制或扫描等方式再现的，存在被篡改或伪造的风险。虽然现代技术可以对复印件进行鉴定以确认其真实性，但鉴定过程相对复杂，且不一定能够完全排除被篡改或伪造的可能性。

最后，从使用场景上来看，原件和复印件的公章也有不同的应用。原件通常用于需要高度法律证明力的场合，如合同签订、法律诉讼等。在这些场合下，原件上的公章能够直接证明合同的合法性和有效性。而复印件则更多用于日常办公、资料归档等场合，作为原件的备份或参考。在这些场合下，虽然复印件上的公章也具有一定的证明力，但通常需要与其他证据相结合才能发挥作用。

综上所述，原件和复印件的公章在法律效力、真实性和使用场景等方面存在显著差异。因此，在处理涉及合同、法律文件等事务时，应尽可能使用原件，并妥善保管好原件，以确保其法律效力和真实性。如果确实需要使用复印件，则应确保其来源可靠、内容完整，并尽可能与其他证据相结合以提高其证明力。