当单位被个人申诉个人所得税时，通常意味着个人对单位为其申报的个税信息存在异议，认为申报信息不准确或存在错误。以下是针对这种情况的一些建议和处理流程：

一、初步了解与核实

1. 接收申诉信息：首先，单位应接收并仔细阅读个人提出的申诉内容，了解具体的异议点和申诉理由。

2. 内部核实：单位应组织相关人员对申诉内容进行内部核实，包括查阅相关的工资单、银行对账单、社保缴纳证明等文件和证据，以确认申报信息的准确性。

二、沟通与协商

1. 与个人沟通：在核实过程中，单位可主动与个人取得联系，了解其具体的申诉原因和诉求，并尝试通过沟通解决误解或纠正错误。

2. 协商解决方案：如果确实存在申报错误，单位应与个人协商确定正确的申报信息，并承诺在后续申报中予以纠正。

三、正式申诉处理

1. 提交申诉材料：如果个人坚持申诉，单位应指导其按照税务机关的要求准备相关申诉材料，如申诉书、证据材料等，并确保材料的真实性和完整性。

2. 协助申诉：单位可协助个人通过税务机关的官方渠道（如个人所得税APP、自然人电子税务局网站或办税服务厅）提交申诉申请，并跟踪申诉进度。

四、配合税务机关调查

1. 接受调查：在申诉处理过程中，税务机关可能会对单位进行调查，单位应积极配合，提供必要的文件和证据，并如实说明情况。

2. 及时整改：如果税务机关调查发现单位确实存在申报错误或违规行为，单位应及时进行整改，并按照规定补缴税款或接受其他处罚。

五、后续处理与反馈

1. 处理结果反馈：单位应将税务机关的处理结果及时反馈给个人，并确保后续申报的准确性。

2. 加强内部管理：为避免类似情况再次发生，单位应加强内部管理，建立健全个税申报审核机制，确保申报信息的准确性和合规性。

综上所述，当单位被个人申诉个人所得税时，应积极应对、认真核实、主动沟通、协助申诉，并配合税务机关的调查和处理。同时，加强内部管理，确保个税申报的准确性和合规性，是预防类似问题再次发生的关键。