恶意占有厂房可能构成犯罪，具体罪名需结合实际情况判断。

1. 可能构成侵占罪：

   • 侵占罪主要涉及未经合法持有者同意，直接占有他人财产，且在知晓该财产归属他人的前提下仍拒绝返还。若行为人通过租赁、借用等方式获得厂房的使用权，但在使用权终止后，未经所有者同意继续占有厂房，且经要求拒不退还，数额较大（各地司法实践中数额标准不同，通常在几千元到上万元之间），则可能构成侵占罪。

2. 可能构成其他犯罪：

   • 若行为人使用暴力、威胁等手段强行侵占他人厂房，则可能构成抢劫罪或寻衅滋事罪等。具体构成何种罪名，需结合行为方式、情节严重程度等因素综合判断。

3. 可能涉及民事纠纷：

   • 厂房作为不动产的一种，其被侵占的行为除了可能构成犯罪外，还可能涉及到对物权的侵害或者合同违约等法律问题。在这种情况下，所有者可以通过民事诉讼来维护自身权益。

4. 法律建议：

   • 遇到厂房被恶意占有的情况，建议及时收集相关证据，如土地厂房权属证明、对方侵占的相关证据等。
   • 可向公安机关报案，由公安机关进行调查处理。
   • 若涉及民事纠纷，可通过民事诉讼来维护自身权益，要求行为人返还厂房并赔偿损失。

综上所述，恶意占有厂房的行为可能构成犯罪，也可能涉及民事纠纷。具体需结合实际情况进行判断，并采取相应的法律措施来维护自身权益。