针对您提出的“司法机关捏造犯罪事实案件怎么处理”的问题，这是一个涉及法律严肃性和公正性的重要议题。以下是对此问题的详细解答：

首先，需要明确的是，司法机关作为执法和司法机构，其职责是依法公正地处理案件，维护法律的尊严和权威。因此，司法机关本身不会捏造犯罪事实。然而，如果司法机关中的个别工作人员存在捏造犯罪事实的行为，这将严重违反法律职业道德和法律法规，必须依法严肃处理。

对于这种情况，处理方式通常包括以下几个方面：

1. 内部调查与处理：

   • 一旦发现司法机关工作人员存在捏造犯罪事实的行为，相关司法机关应立即启动内部调查程序。
   • 调查过程中，应确保公正、客观、全面，充分听取相关人员的陈述和申辩。
   • 如果调查确认存在捏造犯罪事实的行为，应根据情节轻重，对涉事工作人员进行纪律处分，包括但不限于警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等。
   • 同时，应追究其相应的法律责任，包括民事赔偿责任（如赔偿因捏造事实给当事人造成的损失）和刑事责任（如构成犯罪，应依法追究刑事责任）。

2. 外部监督与救济：

   • 当事人如果认为司法机关存在捏造犯罪事实的行为，有权向相关监督机关（如检察机关、纪检监察机关等）进行举报或申诉。
   • 监督机关应及时受理并展开调查，确保当事人的合法权益得到保障。
   • 如果调查确认存在捏造犯罪事实的行为，监督机关应督促相关司法机关依法纠正错误，并对涉事工作人员进行严肃处理。
   • 当事人还可以通过法律途径寻求救济，包括申请国家赔偿等。

3. 预防与警示：

   • 司法机关应加强对工作人员的法律职业道德教育和业务培训，提高他们的法律素养和职业道德水平。
   • 建立健全内部监督机制，加强对案件处理过程的监督和检查，确保案件处理的公正性和合法性。
   • 加大对捏造犯罪事实行为的惩处力度，形成有效的警示和震慑作用。

综上所述，对于司法机关捏造犯罪事实案件的处理，应坚持依法、公正、公开的原则，确保当事人的合法权益得到保障，同时维护法律的尊严和权威。如果您或您身边的人遇到类似问题，建议及时向相关监督机关举报或申诉，并寻求法律帮助。