针对您提出的“铁路职工严重违章怎么处理”的问题，这确实是一个涉及铁路运营安全和职工责任的重要议题。以下是我根据相关法律法规和政策，为您提供的详细解答：
一、法律层面的处理
根据《中华人民共和国刑法》第一百三十二条的规定，铁路职工如果违反规章制度，致使发生铁路运营安全事故，并造成严重后果的，将面临刑事处罚。具体来说，如果造成严重后果，可处三年以下有期徒刑或者拘役；如果造成特别严重后果，则可处三年以上七年以下有期徒刑。这一规定明确了铁路职工在违章行为导致严重事故时的法律责任。
二、行政处罚层面的处理
除了刑事处罚外，铁路职工严重违章还可能面临行政处罚。根据《國家鐵路局鐵路行政處罰裁量權基準》及相关政策解读，国家铁路局已经制定了详细的行政处罚裁量权基准，以规范铁路行政处罚行为。这些基准明确了各种违章行为对应的处罚依据、裁量阶次、使用条件和具体标准。
处罚种类：包括警告、罚款、没收违法所得、责令停产停业、暂扣或者吊销许可证、暂扣或者吊销执照等。
裁量阶次：根据违章行为的严重程度和后果，行政处罚分为不予行政处罚、减轻行政处罚、从轻行政处罚、一般行政处罚和从重行政处罚五个阶次。
具体标准：对于每种违章行为，都明确了具体的处罚标准，如罚款的数额范围、停产停业的期限等。
三、实际案例参考
以您提供的典型案例为例，铁路职工王某某在监护道口作业时违反规章制度，未及时关闭道口拦门，导致一辆货车与货运列车相撞，造成一人死亡、一人轻伤的严重后果。王某某因此被判处有期徒刑一年。这一案例充分说明了铁路职工严重违章可能面临的严重法律后果。
四、建议与措施
加强培训：铁路部门应加强对职工的安全意识培训，提高职工对规章制度的认识和遵守意识。
完善管理：科学合理地制定规章制度，明确各项工作的操作流程和标准，确保职工有章可循、有据可查。
强化监督：建立健全的监督机制，对职工的工作行为进行实时监控和检查，及时发现和纠正违章行为。
以案为鉴：加大对风险研判和隐患排查治理的力度，从实际案例中吸取教训，切实将安全隐患和问题苗头遏制在萌芽阶段。
综上所述，铁路职工严重违章将面临严重的法律后果和行政处罚。因此，铁路部门应加强对职工的培训和管理，提高职工的安全意识和责任意识，确保铁路运营的安全和稳定。同时，职工自身也应严格遵守规章制度，认真履行工作职责，共同维护铁路运营的安全和秩序。