证人做笔录是否会记录在档案，需分情况讨论：

1. 刑事案件中的证人笔录
   在刑事诉讼中，证人笔录作为关键证据材料，会由公安机关、检察院或法院依法保存，并归入案件卷宗（即“刑事档案”）。这类档案通常不对外公开，仅在司法机关内部流转或用于后续诉讼程序（如二审、再审）。若案件涉及严重犯罪，证人笔录可能长期存档；若案件终结且无争议，部分档案可能按保密规定封存或销毁，但具体处理需符合《刑事诉讼法》及档案管理规定。

2. 民事或行政案件中的证人笔录
   民事或行政诉讼中，证人笔录同样会归入案件卷宗，由法院保存。这类档案的保存期限一般与案件审理期限相关，案件终结后可能移交档案馆长期保存，但公众无法随意查询，仅当事人或律师凭合法手续可申请调阅。

3. 笔录是否会进入证人个人档案
   需明确区分“案件档案”与“个人档案”：

   • 案件档案：记录诉讼过程，与证人无关；
     
   • 个人档案：通常指人事、学籍、信用等档案，证人笔录不会自动录入个人档案，除非证人因作伪证等行为被追究法律责任（如罚款、拘留或刑事处罚），相关处罚记录可能记入个人违法犯罪记录，但这是独立于笔录的法律后果。

总结：证人笔录会保存在案件卷宗中，但一般不会直接影响证人个人档案，除非证人因作证行为违法。若您有具体案件背景或担忧，可进一步说明情况，我会为您详细分析。