结论：被执行人还款了但执行人不同意撤销的情况下，被执行人可以通过法律途径来维护自己的权益，具体做法取决于还款的具体情况以及执行程序的进展。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、还款情况与执行程序的关系
全额还款：
- 如果被执行人已经全额偿还了债务，那么根据法律规定，执行程序应当终止。此时，即使执行人不同意撤销，被执行人也可以向法院提出申请，要求终止执行程序并撤销相关执行措施。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，执行完毕后，据以执行的判决、裁定和其他法律文书确有错误，被人民法院撤销的，对已被执行的财产，人民法院应当作出裁定，责令取得财产的人返还；拒不返还的，强制执行。虽然此条款直接针对的是执行依据被撤销的情况，但全额还款后执行程序应终止的原理与之相通，即执行目的已达成，程序应自然终止。
部分还款：
- 如果被执行人只是部分还款，那么执行程序可能会继续进行，直至债务全部清偿。在此情况下，执行人有权拒绝撤销执行申请，因为债务尚未完全履行。
- 建议：被执行人可以与执行人协商，制定还款计划，并尽快履行剩余债务，以促使执行人同意撤销执行申请。
二、执行人的权利与义务
执行人的权利：
- 执行人有权要求被执行人履行债务，并在被执行人不履行时申请强制执行。
- 在执行过程中，执行人有权监督被执行人的还款情况，并决定是否同意撤销执行申请。
执行人的义务：
- 执行人应当遵循诚实信用原则，不得滥用执行权利。
- 如果被执行人已经履行了债务，执行人应当同意撤销执行申请，并配合法院终止执行程序。
三、被执行人的法律救济途径
向法院提出异议：
- 如果被执行人认为执行人的行为违反了法律规定或执行程序存在错误，可以向法院提出异议。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人、利害关系人认为执行行为违反法律规定的，可以向负责执行的人民法院提出书面异议。
申请执行监督：
- 被执行人还可以向上级法院申请执行监督，要求上级法院对下级法院的执行行为进行审查。
- 建议：在申请执行监督时，被执行人应提供充分的证据证明执行行为存在错误或违法情况。
四、实际操作中的注意事项
保留还款证据：
- 被执行人在还款时，应保留好还款凭证，如银行转账记录、收据等，以证明自己已经履行了债务。
及时沟通：
- 被执行人应与执行人保持及时沟通，了解执行进展和执行人的意见，以便及时调整自己的还款策略。
寻求法律帮助：
- 如果被执行人在执行过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的权益。
总结与建议：被执行人还款了但执行人不同意撤销的情况下，被执行人应首先确认自己是否已经全额还款。如果已经全额还款，可以向法院提出申请终止执行程序；如果只是部分还款，应与执行人协商制定还款计划并尽快履行剩余债务。同时，被执行人应保留好还款证据，及时与执行人沟通，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。