结论：棋牌室有营业执照并不一定完全合法，但拥有营业执照是合法经营的前提条件之一。要确保棋牌室合法经营，还需满足其他一系列条件和获得相关部门的批准或许可。

详细分析：

1. 营业执照的重要性：

   • 营业执照是企业、个体工商户等市场主体准许从事营利性经营活动的法定凭证。对于棋牌室而言，拥有营业执照意味着其已经按照法律规定进行了注册登记，具备了合法经营的基本条件。

2. 合法经营的其他条件：

   • 除了营业执照外，棋牌室还需要获得文化部门的娱乐经营许可证，以及消防、卫生、环境保护等部门的批准文件。这些证件或批准文件是确保棋牌室经营活动符合各方面规范和要求的重要步骤。
   • 例如，棋牌室必须确保经营场所符合建筑安全、消防安全及环保标准，配备必要的消防设施，以确保紧急情况下的安全疏散。同时，棋牌室不得以赌博为目的进行经营，否则将无法获得相关许可证并面临法律制裁。

3. 未取得相关证件或批准文件的后果：

   • 如果棋牌室未取得营业执照或其他相关许可证、批准文件擅自经营，将可能面临市场监督管理部门或工商行政管理部门的处罚。这些处罚包括但不限于责令停止经营活动、没收违法所得以及处以一定数额的罚款。在情节严重的情况下，处罚力度可能会更大。

4. 地区差异与特殊注意事项：

   • 不同地区的具体流程和所需材料可能存在差异。例如，某些地区可能对棋牌室的设立有特定的距离限制（如学校、幼儿园周围等特定区域内通常不允许开设棋牌室）。因此，在办理前务必详细咨询当地工商行政管理部门或相关文化、消防等部门，以确保顺利取得所有必要的证件和批准文件。

法律建议：

• 如果您打算开设棋牌室，请务必先了解并满足所有相关的法律法规要求，包括但不限于办理营业执照、娱乐经营许可证以及消防、卫生、环境保护等部门的批准文件。
• 在经营过程中，请严格遵守各项法律法规，确保棋牌室的合法经营。避免任何形式的违法行为，如赌博等，以免面临严重的法律后果。
• 如果您在办理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。