关于设施农用地是否可以建厂房的问题，这确实是一个需要细致解答的疑问。首先，我们要明确的是，设施农用地并非绝对不能修建厂房，但这一行为必须严格遵循相关法律法规，并依法办理完整的审批手续。

一、法律背景与土地用途管制

我国实行严格的土地用途管制制度，土地被明确分为农用地、建设用地和未利用地三大类。农用地主要用于农业生产活动，其转为建设用地受到严格限制。而建设厂房，通常应当使用专门的工业用地或建筑用地。

二、设施农用地的定义与用途

设施农用地包括生产设施用地、附属设施用地及配套设施用地，这些土地的主要用途是服务于农业生产和与农业生产直接相关的活动。例如，如果厂房的建设目的是为了烘干、储存农产品等直接与农业生产相关的用途，那么这样的厂房建设在符合一定条件下，是有可能被允许的。

三、合规建设与审批流程

1. 合规情况：

   • 当厂房建设目的与农业生产直接相关，并且已经按照规定办理了所有必要的审批手续时，设施农用地上是可以建设厂房的。
   • 审批流程通常涉及向当地农业农村部门和自然资源部门提出申请，经过审核、规划许可等一系列法定程序，获得批准后方可动工建设。

2. 违规后果：

   • 如果厂房建设用于非农业生产的工业生产、商业经营等用途，那么这就属于擅自改变土地用途，违反了土地管理法律法规。
   • 违规者将面临县级以上人民政府自然资源主管部门的责令改正、罚款，甚至可能承担刑事责任等法律后果。

四、实际操作建议

• 在计划于设施农用地上修建厂房之前，务必详细咨询当地自然资源主管部门，了解具体的政策法规、申请流程以及限制条件。
• 确保建设项目完全符合土地利用总体规划，并严格按照审批要求进行建设和使用，以避免不必要的法律风险和经济损失。

五、特别提醒

• 对于基本农田，我国法律有更为严格的规定，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内进行建房（包括建厂房）等活动。因此，基本农田是绝对禁止用于建设厂房的。
• 对于一般农田，虽然相较于基本农田有一定的灵活性，但建设厂房同样受到严格限制，必须依法办理农用地转用审批手续，并符合相关规划要求。

综上所述，设施农用地上能否修建厂房，取决于具体的使用目的和是否依法办理了审批手续。在做出决策之前，请务必确保了解并遵守相关法律法规，以确保土地使用的合法性和合规性。如有任何疑问或需求，建议咨询当地自然资源主管部门或专业律师以获取准确的法律意见和指导。