您好，关于您提出的“电瓶车闯红灯被罚款是否会留案底”的问题，我可以给您一个详细且清晰的解答。
首先，我们需要明确“案底”的定义。在我国法律体系中，“案底”特指犯罪记录，即个人因犯罪行为被人民法院判处有罪后留下的记录。这种记录对个人生活和工作可能产生长远影响。
接下来，我们分析电瓶车闯红灯的性质。电瓶车闯红灯属于违反交通规则的行为，在法律上通常被视为一般的行政违法行为，并不构成犯罪。因此，从一般意义上来说，电瓶车闯红灯被罚款并不会留下案底。
然而，电瓶车闯红灯会受到相应的行政处罚。具体处罚措施取决于电瓶车被认定为非机动车还是机动车：
如果电瓶车被认定为非机动车，闯红灯后将面临警告或五元以上五十元以下的罚款。若驾驶人拒绝接受罚款处罚，相关部门有权扣留其非机动车。
如果电瓶车属于机动车类别（如某些新能源电动车），闯红灯则会被扣驾驶证分，一次记6分，并处以警告或二十元以上二百元以下的罚款。
这些处罚记录会留存于交通管理部门的系统中，用于交通管理和违法处理，但它们并不等同于刑事犯罪记录，也就是不会留下“案底”。
不过，有一种特殊情况需要注意。如果电瓶车闯红灯行为导致了严重的交通事故，造成了重大人员伤亡或财产损失，并且驾驶人在事故中承担主要责任或全部责任，其行为可能构成交通肇事罪等刑事犯罪。在这种情况下，经过法院的审判并被认定有罪后，驾驶人就会留下案底。
因此，虽然电瓶车闯红灯被罚款一般不会留下案底，但为了自身和他人的安全考虑，我建议您在行驶过程中严格遵守交通规则，避免闯红灯等违法行为。多次或严重的交通违法行为不仅可能影响您的日常生活和工作，甚至可能触犯刑法，留下不可磨灭的案底。
希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。