结论前置：
- 自动离职本身并不直接决定扣几天工资，工资扣除需依据用人单位的规章制度、劳动合同约定以及劳动法的相关规定。
- 用人单位不能随意克扣工资，扣除部分需合理且不得使劳动者实际所得低于当地最低工资标准。
详细分析：
一、自动离职与工资扣除的基本原则
自动离职，即劳动者未按照法定程序或劳动合同约定提前通知用人单位而擅自离职的行为。在处理自动离职员工的工资问题时，用人单位应遵循以下基本原则：
- 按照实际用工天数计算工资：员工自动离职时，其工资应当按照实际工作的天数来计算，确保员工获得与其付出劳动相对应的工资报酬。
- 不得无故克扣工资：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。用人单位在劳动者自动离职时，应结清其应得的工资，除非存在合法合规的扣除理由。
二、合法扣除工资的情形及标准
经济损失赔偿：
- 如果劳动者自动离职给用人单位造成了经济损失，如带走重要业务资料导致业务无法开展、违反保密协议等，用人单位可以要求劳动者承担赔偿责任。
- 赔偿可以从劳动者的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。这一规定依据的是《工资支付暂行规定》第十六条。
旷工扣减：
- 如果员工在离职前存在旷工行为，用人单位可以按照旷工日数扣减相应的工资。通常是日工资数乘以旷工天数，但具体扣减标准需依据用人单位的规章制度或劳动合同约定。
- 日工资计算公式：\(日工资 = 月工资 \div 21.75天\)（21.75天为月平均计薪天数）。
三、自动离职工资扣除的注意事项
规章制度需明确并公示：
- 用人单位应在规章制度中明确扣除工资的要求和标准，并公开公示告知员工，以确保在扣除工资时有法可依、有据可查。
- 如果规章制度或劳动合同中没有明确规定自动离职的扣工资标准，用人单位不能随意扣减工资。
避免违法扣除：
- 用人单位必须严格遵守法律法规的规定，在扣除工资时不得违反相关规定，否则将可能面临法律责任。
- 例如，用人单位不能以自动离职为由，一次性扣除员工全部工资或大量工资，这种行为是违法的。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同或公司规章制度中有关于自动离职扣工资的明确、合理规定，并且该规定已向员工公示告知，在不违反法律规定的情况下，可能会按照约定执行。
- 但即使劳动合同中有约定，用人单位也不能违反法律关于工资扣除的限制性规定。
四、特殊情况下的处理
试用期自动离职：
- 试用期员工自动离职时，同样需要按照实际用工天数计算工资，并遵守上述扣除原则和标准。
- 试用期员工也享有获得劳动报酬的权利，用人单位不能因其处于试用期而随意扣减工资。
未签订劳动合同的情况：
- 如果用人单位未与劳动者签订劳动合同，但存在实际的用工行为，即视为建立了劳动关系，受《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规保护。
- 在这种情况下，用人单位同样不能随意扣减自动离职员工的工资，且还需承担未签订劳动合同的法律责任，如向劳动者支付二倍工资差额等。
五、劳动者权益保护
- 如果用人单位以自动离职为由不合理地克扣大量工资，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 劳动者在投诉或申请仲裁时，应提供相关证据，如工资条、考勤记录、劳动合同等，以证明用人单位存在违法扣除工资的行为。
举例说明：
假设某员工月工资为5000元，因自动离职被用人单位扣除1000元工资。如果该员工在离职前存在旷工行为，且用人单位的规章制度中明确规定旷工一天扣减日工资的两倍作为罚款，同时该员工旷工了两天，那么按照日工资计算公式，该员工的日工资为\(5000 \div 21.75 \approx 229.89元\)，旷工两天应扣减的工资为\(229.89 \times 2 \times 2 = 919.56元\)。在这种情况下，用人单位扣除1000元工资就超出了合法扣减的范围，劳动者有权要求用人单位返还多扣的部分。
总结与建议：
自动离职扣工资的问题需要根据具体情况和法律法规来确定。用人单位应依法行事，确保工资扣除的合法性和合理性；劳动者也应了解自己的权益，必要时采取法律手段维护自身利益。如果您在自动离职后遇到了工资扣除的问题，或者对用人单位的扣减行为有异议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。