单位完全可以申请劳动仲裁。在劳动法律关系中，当用人单位与劳动者之间因劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险、福利待遇、培训、劳动保护、劳动条件以及劳动合同的订立、履行、变更、解除或终止等方面产生争议时，用人单位有权向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，以维护自身的合法权益。以下从几个方面详细阐述：

一、劳动仲裁的适用范围

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，用人单位与劳动者之间发生的以下劳动争议均可申请劳动仲裁：

1. 确认劳动关系存在的争议：比如，单位认为与某劳动者存在劳动关系，但劳动者否认，此时单位可以申请仲裁确认劳动关系。
2. 劳动合同订立、履行、变更、解除和终止过程中产生的争议：例如，单位因劳动者严重违反规章制度而解除劳动合同，但劳动者认为单位解除行为违法，双方因此产生争议，单位可以申请仲裁。
3. 因除名、辞退、辞职和离职引发的争议：如单位对劳动者作出除名决定，劳动者不服，单位可以申请仲裁来确认除名决定的合法性。
4. 关于工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训及劳动保护的争议：比如，单位未按照法律规定为劳动者缴纳社会保险，劳动者提出异议，单位认为已履行相关义务，此时单位可以申请仲裁来明确责任。
5. 劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或赔偿金等支付问题引发的争议：若单位认为已足额支付劳动者劳动报酬，但劳动者主张未足额支付，双方产生争议，单位可以申请仲裁。
6. 法律、法规规定的其他可申请劳动仲裁的争议。

二、劳动仲裁的申请流程

用人单位申请劳动仲裁需遵循以下步骤：

1. 提交书面申请：单位需向劳动争议仲裁委员会提交书面的仲裁申请书，并按照被申请人（即劳动者）的人数提交副本。仲裁申请书应详细载明劳动者的基本信息、单位的基本信息、仲裁请求及其所依据的事实和理由、证据及证据来源、证人姓名及住所等。
2. 受理与审理：劳动争议仲裁委员会在收到申请书后五日内进行审查，认为符合受理条件的将予以受理，并通知单位；不符合受理条件的，将书面通知单位不予受理，并说明理由。受理后，案件一般将在四十五日内审理结案，复杂案件可延长十五日。
3. 裁决与执行：劳动争议仲裁委员会作出裁决后，单位和劳动者均需遵守。如任何一方对裁决不服，可在法定时间内向人民法院提起诉讼。

三、申请劳动仲裁时的注意事项

1. 时效限制：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，单位应及时行使权利，避免超过时效。例如，若单位发现劳动者在离职时带走了单位的财物，应在知道该情况后的一年内申请仲裁，否则可能因超过时效而丧失胜诉权。
2. 证据准备：在申请劳动仲裁前，单位应充分收集并整理相关证据材料，如劳动合同、工资单、考勤记录、规章制度等，以证明其主张的事实和请求的合理性。比如，单位主张劳动者违反了竞业限制约定，就需要提供与劳动者签订的竞业限制协议以及劳动者违反协议的相关证据。
3. 程序遵守：单位在申请劳动仲裁过程中应严格遵守法定程序，包括按时提交申请材料、参加仲裁庭审、遵守仲裁庭纪律等。若单位未按照程序要求进行，可能会影响仲裁结果。

四、特殊情况下的管辖问题

若单位与劳动者不在同一地区，即存在异地申请劳动仲裁的情况，此时主要取决于劳动合同履行地和单位所在地的具体情况。根据相关法律法规，劳动仲裁的管辖由劳动合同履行地或单位所在地的劳动争议仲裁委员会负责。若双方当事人分别向劳动合同履行地和单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，由劳动合同履行地的劳动争议仲裁委员会管辖。例如，单位在A市注册，但劳动者在B市工作，若双方产生劳动争议，单位可以选择向A市或B市的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，但如果劳动者也向B市的仲裁委员会申请了仲裁，那么将由B市的仲裁委员会管辖。

综上所述，单位在与劳动者发生劳动争议时，完全有权且应当按照法定程序向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自身的合法权益。同时，单位也应注重证据的收集和时效的把握，确保仲裁申请的顺利进行。若您在劳动仲裁方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。