合同甲方持有三份而乙方仅持有一份，这种分配方式本身并不直接构成不合理或违法，但其合理性需结合具体情境和合同条款来判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合同份数的法律意义：

   • 合同份数通常用于确保合同双方及可能涉及的第三方（如见证人、备案机关等）都能持有合同的副本，以便在需要时查阅或作为证据。
   • 法律并未规定合同必须一式几份，因此合同份数的分配更多是基于双方协商和实际需要。

2. 合同份数分配的合理性判断：

   • 双方协商一致：如果合同份数的分配是双方协商一致的结果，且没有违反法律法规的强制性规定，那么这种分配方式就是合理的。
   • 实际需要：合同份数的分配也应考虑实际需要。例如，如果甲方需要向多个部门或机构提交合同副本，而乙方只需要一份用于内部存档，那么甲方持有三份而乙方持有一份就是合理的。
   • 公平原则：虽然合同份数的分配不直接涉及合同内容的公平性，但如果分配方式明显偏向一方，可能引发对方对合同公平性的质疑。在这种情况下，双方应通过协商来调整合同份数的分配，以维护合同的公平性和双方的信任关系。

3. 可能存在的风险与建议：

   • 风险：如果合同份数的分配不合理，且未得到双方的充分理解和同意，可能导致一方在合同履行过程中产生不满或争议。例如，如果乙方需要合同副本用于某些法律程序或业务操作，但只持有一份，可能面临不便或风险。
   • 建议：
     • 在签订合同前，双方应充分沟通并明确合同份数的分配方式，确保双方都能接受并理解其合理性。
     • 如果可能的话，可以在合同中明确约定合同份数的分配、保管和使用方式，以避免后续争议。
     • 如果一方对合同份数的分配有异议，应及时提出并与对方协商解决，以确保合同的顺利履行和双方的合法权益。

4. 特殊情况下的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如涉及政府审批、备案或第三方监管的合同，可能需要按照特定要求准备合同份数。在这种情况下，双方应遵守相关法律法规和监管要求，确保合同份数的分配符合规定。

总结来说，合同甲方持有三份而乙方仅持有一份，这种分配方式本身并不直接构成不合理或违法。但其合理性需根据双方协商、实际需要以及公平原则来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。