当金融机构的存款准备金不足时，会面临一系列的处罚措施。具体来说，如果金融机构按法人统一存入人民银行的准备金存款低于上旬末一般存款余额的8%，人民银行会对其不足部分按照每日万分之六的利率处以罚息。这一措施旨在确保金融机构有足够的准备金来应对客户提取存款和资金清算的需求，维护金融市场的稳定。

此外，如果金融机构的分支机构在人民银行的准备金存款账户出现透支，人民银行也会按照相关规定予以处罚。透支行为可能引发金融风险，因此人民银行对此类行为采取严格的监管措施。

同时，金融机构还需要按时报送旬末一般存款余额表和月末日计表等财务数据。如果金融机构不按时报送这些数据，依据《中华人民共和国商业银行法》第七十八条，人民银行也会对其进行处罚。这些处罚措施可以并处，意味着金融机构可能同时面临罚息和行政处罚。

总的来说，存款准备金制度是中央银行进行货币政策调控和金融监管的重要手段。金融机构必须严格遵守相关规定，确保存款准备金的充足性，以维护金融市场的稳定和健康发展。如果违反规定，将面临严厉的处罚措施。