当药店执业药师不在岗时，药店可能会面临一系列的行政处罚，这主要取决于具体的违规情况和相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细解答：
一、执业药师不在岗的违规情况
执业药师不在岗通常指的是执业药师未在药店现场履行其职责，包括但不限于处方审核、用药指导等关键任务。这种违规情况可能涉及“执业药师挂证”行为，即执业药师的注册单位与实际工作单位不一致，导致执业药师长期不在岗。
二、可能的行政处罚
警告与罚款：
- 根据《中华人民共和国药品管理法》及相关规定，药店若存在执业药师不在岗且未凭处方销售处方药的行为，市场监督管理部门有权对药店进行警告，并处以罚款。罚款的金额会根据违规的严重程度、销售处方药的种类和数量等因素来确定。
责令改正：
- 市场监督管理部门会下达《责令改正通知书》，要求药店限期整改，确保执业药师在岗履职，并停止未凭处方销售处方药的行为。
注销执业药师注册资格：
- 对于存在“执业药师挂证”等严重违规行为的药店，市场监督管理部门还会通报上级主管部门，依法注销该药店执业药师的执业药师注册资格。
其他行政处罚：
- 根据具体情况，药店还可能面临其他行政处罚，如没收违法所得、吊销药品经营许可证等。
三、实际案例参考
赣州市案例：
- 赣州市市场监督管理局对某药店进行检查时，发现执业药师未在岗履职且未凭处方销售处方药。该药店被警告并处罚款，同时执业药师的注册资格被注销。
皮山县案例：
- 皮山县市场监督管理局对某医药有限公司进行检查时，发现执业药师不在岗期间销售了处方药。该药店被责令改正，并处以罚款。虽然药店提出了陈述申辩意见，但市场监督管理部门根据违规情况和相关法律法规作出了相应的行政处罚。
四、建议与措施
加强内部管理：
- 药店应建立健全内部管理制度，确保执业药师在岗履职，并严格遵守相关法律法规和规定。
提高法律意识：
- 药店应加强对员工的法律培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识，避免违规行为的发生。
积极配合监管：
- 药店应积极配合市场监督管理部门的检查和监管工作，及时整改存在的问题，确保药品经营活动的合法性和合规性。
综上所述，药店执业药师不在岗可能会面临警告、罚款、责令改正、注销执业药师注册资格等行政处罚。药店应加强内部管理、提高法律意识并积极配合监管工作，以避免违规行为的发生。