针对您提出的“超员50%以上100%以下如何处罚”的问题，以下是根据相关法律法规整合后的详细解答：

一、总体处罚原则

超员行驶是严重的交通违法行为，其处罚力度和后果依据车辆类型以及超员程度而有所不同。对于超员50%以上100%以下的情况，驾驶员将面临罚款、记分以及可能的车辆扣留等处罚。

二、各类车辆的具体处罚规定

1. 公路客运车辆（包括旅游客运车辆）

   • 罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，载客超过额定乘员50%以上未达到100%的，处五百元以上二千元以下罚款。
   • 记分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，载客超过核定人数50%以上未达到100%的，一次记9分。
   • 其他措施：由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。

2. 普通小型载客汽车

   • 罚款：虽然《道路交通安全法》第九十二条未直接提及普通小型载客汽车超员的具体罚款数额，但根据该法及其实施条例的精神，以及地方性法规的具体规定，一般处二十元以上二百元以下罚款，具体数额可能因地区差异而有所不同。
   • 记分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，载人超过核定人数50%以上未达到100%的，一次记6分。

3. 货运机动车

   • 罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，超过核定载质量50%以上未达到100%的，处五百元以上二千元以下罚款。
   • 记分：依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，载物超过最大允许总质量50%以上的，一次记6分。
   • 其他措施：同样，由公安机关交通管理部门扣留机动车至违法状态消除。

三、法律责任延伸

• 若超员行为导致交通事故，驾驶员除面临上述行政处罚外，还可能需承担民事赔偿责任，甚至因触犯刑法中的交通肇事罪而面临刑事责任。
• 对于运输单位，如果其车辆存在超员情况，并且经处罚不改，那么对直接负责的主管人员将处二千元以上五千元以下罚款。

四、建议与提醒

• 驾驶员应严格遵守交通法规，不得超员行驶，以确保乘客和自身的生命安全。
• 运输单位应加强安全管理，定期对车辆进行检查和维护，确保车辆不超员、不超载。
• 对于已经发生的超员行为，驾驶员和运输单位应积极接受处罚并改正错误，以避免更严重的法律后果。

综上所述，超员50%以上100%以下的处罚是严厉的，旨在通过法律手段遏制这一违法行为的发生。请广大驾驶员和运输单位务必遵守相关规定，共同维护道路交通安全。