结论前置：

1. 小时工旷工一天扣三天工资的做法是不合法的。它违反了我国劳动法的相关规定，且即使合同中有此类约定，也可能因违反法律强制性规定而无效。

详细分析：

1. 工资支付原则与克扣工资的定义：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位必须按时足额支付工资，无权随意扣减。对于小时工而言，其工资按实际工作小时数计算，若旷工一天，用人单位最多只能不支付该日的工资，而不能额外扣除其他日子的工资。

2. 合同约定的有效性：

   • 即使劳动合同或公司规章制度中规定了“旷工一天扣三天工资”的条款，根据《劳动合同法》第二十六条，如果这种条款免除了用人单位的法定责任、排除了劳动者的权利，或者违反了法律、行政法规的强制性规定，那么这些条款是无效的。因此，即便合同中有此类约定，也不具备法律效力。

3. 经济损失的赔偿：

   • 如果小时工的旷工行为确实给用人单位造成了实际经济损失，用人单位可以要求赔偿。但需提供充分证据证明损失的存在和具体金额，且赔偿的扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这意味着，用人单位不能随意以扣工资的方式替代合理的损失赔偿。

4. 员工权益保护与维权途径：

   • 面对不合理的工资扣除，小时工有权首先与用人单位协商解决；协商不成时，可以向当地的劳动保障部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在必要时，还可以依法提起诉讼。

建议与总结：

• 用人单位：应严格遵守法律法规，确保员工的工资权益得到保障。在制定规章制度或劳动合同条款时，应确保规定的合法性、合理性和公平性，避免侵犯劳动者的合法权益。
• 劳动者：在遇到类似情况时，应积极维护自己的权益，通过合法途径寻求帮助和解决问题。同时，也应遵守用人单位的规章制度和劳动合同的约定，避免无故旷工等行为的发生。

综上所述，“小时工旷工一天扣三天工资”的做法不仅违反了劳动法的相关规定，也损害了劳动者的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。