当您的车停在地下车库被水淹时，保险公司是否赔付主要取决于您购买的保险险种以及事故的具体情况。以下是对此问题的详细解答：
一、可适用的险种及赔偿范围
交强险：
- 不赔付：交强险主要保障交通事故中对第三方造成的人身伤亡和财产损失进行赔偿。车辆在地下室被淹并不属于交通事故范畴，因此交强险不会对此进行赔偿。
车辆损失险（车损险）：
- 可能赔付：如果您购买了车损险，并且车辆被淹是由于自然灾害如暴雨、洪水等导致的，那么这通常属于车损险的赔偿范围。但需要注意的是，如果车辆未按规定停放或者车辆本身存在质量问题导致损失扩大，保险公司可能会减免赔偿责任。
- 特别说明：对于2020年9月19日后购买的车险，车损险中已包含涉水责任，因此发动机损坏也可能得到赔偿。但对于旧版车险，若未附加涉水险，且车辆在积水路面行驶导致熄火后二次启动造成发动机损坏，则通常不在赔付范围内。
涉水险（发动机特别损失险）：
- 专门赔付：涉水险是专门针对车辆因涉水行驶或水淹导致的发动机损坏进行赔偿的险种。如果您的车辆在地下室被淹后，不幸在水中启动了车辆导致发动机损坏，并且您购买了涉水险，那么保险公司会对发动机的损坏进行赔偿。
第三者责任险（三者险）：
- 赔偿对象：如果车辆被淹引发了其他财产损失或人身伤害（如车库设施损毁、人员受伤），那么您可以通过三者险进行赔偿。
二、理赔流程指引
立即报案：
- 发现车辆被淹后，您应第一时间拨打保险公司的客服电话进行报案。避免超过报案时效（通常是48小时），以免影响理赔。
现场查勘定损：
- 等待保险公司的查勘员到达现场，配合他们完成事故原因的核实和损失的评估。如果条件允许，您可以拍摄现场照片作为补充证据。
提交索赔材料：
- 根据保险公司的要求，提供行驶证、驾驶证、保险单等基础材料，以及维修发票、气象证明（如需）等辅助文件。
审核与赔付：
- 保险公司审核通过后，会按照合同约定将赔款支付至您指定的账户。如果您对理赔结果有异议，可以申请复核或者通过法律途径解决。
三、关键注意事项
- 避免二次启动：车辆涉水后，切勿尝试强行启动发动机，否则可能导致发动机损坏扩大，并且这部分损失保险公司可能会免责。
- 保留证据链：完整保存报警记录、物业通知、救援凭证等材料，以强化您的理赔依据。
- 关注免责条款：仔细阅读保险合同中的免赔情形，例如未年检的车辆可能被拒赔。
综上所述，当您的车停在地下车库被水淹时，能否获得保险赔付主要取决于您是否购买了相应的保险险种，并且需要遵循保险合同的约定和相关法律法规的规定。在遭遇此类情况时，请保持冷静，及时报案并配合保险公司的理赔流程。