如果您的租车被运管扣押，这通常是因为车辆涉嫌违反了相关的交通运输法规，比如未办理客运出租汽车营运证件而从事客运出租汽车经营活动等。针对这种情况，以下是一些清晰、详细、有深度的处理步骤和建议：

一、了解扣押原因

首先，您需要向扣押车辆的运管部门（如交通运输综合行政执法局）了解具体的扣押原因。这通常可以通过查看《行政强制措施决定书》或车辆暂扣凭证来得知。了解原因后，您可以更有针对性地准备后续的处理工作。

二、准备相关证件和材料

根据运管部门的要求，您需要准备相关的证件和材料以进行权利申报和接受调查处理。这些材料通常包括：

• 《行政强制措施决定书》或车辆暂扣凭证原件
• 驾驶证
• 行驶证
• 身份证
• 租车合同（如果租车公司已将合同上传至交管部门备案，则可能不需要额外提供）

三、前往运管部门处理

携带好上述证件和材料后，您需要前往运管部门指定的地点（如乌鲁木齐市新市区北站东路13号的交通运输综合行政执法局）进行权利申报并接受调查处理。在处理过程中，您需要如实陈述事实，提供必要的证据和材料，并配合运管部门的调查工作。

四、处理违法事宜

如果扣押是因为您或租车公司存在违法行为（如未办理营运证件从事客运出租汽车经营活动），那么您需要按照运管部门的要求处理这些违法事宜。这可能包括缴纳罚款、补办相关证件等。在处理违法事宜时，请务必遵守相关法律法规和运管部门的规定。

五、领取车辆

在处理完违法事宜并满足运管部门的要求后，您可以前往指定地点领取被扣押的车辆。在领取车辆时，请务必检查车辆是否完好无损，并确认所有相关手续已经办理完毕。

六、后续注意事项

• 保留好相关凭证：在处理过程中，请务必保留好所有相关的凭证和文件，以备后续需要。
• 了解租车合同条款：在租车前，请仔细阅读租车合同中的条款和条件，特别是关于违法处理和车辆扣押的部分。
• 遵守法律法规：在未来的租车和使用过程中，请务必遵守相关的法律法规和交通规则，避免再次发生类似的情况。

七、特殊情况处理

如果租车公司已将承租人合同上传至交管部门备案，且违法信息已推送至您的“交管12123”APP，您也可以通过该APP的【违法处理业务】——【租赁车违法处理】进行查看并处理相关违法事宜。但请注意，这并不免除您前往运管部门进行权利申报和接受调查处理的义务。

希望以上建议能对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或困难，请及时咨询运管部门或相关法律专业人士的意见。