在处理机动车与机动车之间发生交通事故，且双方分别承担主次责任的情况下的赔偿问题时，我们需要遵循一系列明确的步骤和规则。以下是对这一问题的详细解答：

一、明确事故主体与责任比例

首先，要明确的是，当两辆机动车发生交通事故，并确定主次责任后，赔偿责任的划分将主要依据双方的责任比例。一般来说，主要责任方可能承担70%（这个比例可能根据具体情况在60%-90%之间调整），而次要责任方则承担30%（同样，这个比例也可能在10%-40%之间调整）。具体比例需由交警部门或相关机构根据事故现场情况、证据等综合裁定。

二、交强险的先行赔付

在赔偿计算过程中，交强险（机动车交通事故责任强制保险）将首先进行赔付。交强险对被保险机动车发生道路交通事故造成的受害人（不包括本车人员和被保险人）的人身伤亡、财产损失，在责任限额内予以赔偿。责任限额包括：

• 死亡伤残赔偿限额：18万元
• 医疗费用赔偿限额：1.8万元
• 财产损失赔偿限额：0.2万元

若机动车一方无责任，则赔偿限额相应降低。交强险的赔付是不考虑事故责任比例的，即无论责任如何划分，交强险都会在上述限额内先行赔付。

三、超出交强险部分的赔偿

交强险赔付后，若仍有不足部分，则根据双方的责任比例进行分担。例如，若主要责任方承担70%的责任，次要责任方承担30%的责任，那么超出交强险赔偿限额的部分，将按照这一比例进行分配。

四、商业三者险的补充赔付

如果主要责任方购买了商业三者险（第三者责任险），那么超出交强险赔偿限额且应由主要责任方承担的部分，可以由商业三者险根据保险合同约定进行赔付。商业三者险的赔付金额将根据责任比例和保险合同条款进行计算。

五、个人赔偿部分

当交强险和商业三者险的赔偿总额仍不足以弥补受害人全部损失时，剩余部分将由事故责任方按照责任比例用个人财产进行赔偿。

六、赔偿项目与计算

赔偿项目包括但不限于医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等。若造成残疾或死亡，还需赔偿辅助器具费、残疾赔偿金、丧葬费和死亡赔偿金等。各项赔偿项目的计算需依据相应标准和证据，如医疗费需提供医疗发票，误工费需提供收入证明和误工时间证明等。

七、实际操作建议

1. 及时报警并保护现场：以便后续勘查和责任认定。
2. 收集证据：包括证人证言、现场照片、视频等，为赔偿计算提供依据。
3. 联系保险公司：及时报案并了解保险赔付流程和所需材料。
4. 寻求专业帮助：处理机动车交通事故赔偿问题时，建议寻求专业律师或相关机构的帮助，以确保自身权益得到妥善维护。

综上所述，机动车与机动车之间发生交通事故且双方承担主次责任时，赔偿责任的划分和计算需遵循法律规定和实际案情进行灵活调整。通过明确事故主体与责任比例、交强险的先行赔付、超出交强险部分的赔偿、商业三者险的补充赔付、个人赔偿部分以及赔偿项目与计算等步骤，我们可以确保赔偿的公平性和合理性。