程序违规在合同纠纷中的后果，通常涉及合同效力、责任承担及纠纷解决方式等多个方面，具体如下：

1. 合同效力可能受影响：

   • 如果合同在签订或履行过程中存在程序违规，如未按照法定形式签订（如应当书面而未书面）、未履行必要的审批或登记手续等，这可能导致合同效力受到影响。根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的合同，可能被认定为无效或部分无效。例如，某些特定类型的合同（如房屋买卖合同）需要办理登记手续才生效，若未办理，则合同可能不生效。

2. 责任承担可能加重：

   • 程序违规可能导致违约方承担更重的法律责任。在合同纠纷中，如果一方因程序违规导致合同无法履行或造成对方损失，该方可能需要承担违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。而且，如果程序违规构成欺诈、胁迫等情形，还可能涉及撤销合同或承担惩罚性赔偿责任。

3. 纠纷解决方式可能受限：

   • 程序违规可能影响纠纷的解决方式。例如，如果合同中约定了仲裁条款，但仲裁条款的签订程序存在违规（如未经双方充分协商或未明确约定仲裁机构等），则可能导致仲裁条款无效，双方可能需要通过诉讼方式解决纠纷。此外，程序违规还可能影响诉讼中的证据效力、举证责任分配等，从而影响纠纷的解决结果。

4. 具体案例分析：

   • 假设甲乙双方签订了一份买卖合同，约定甲向乙购买一批货物，并约定了交货时间和付款方式。但在合同履行过程中，甲发现乙提供的货物存在质量问题，且乙在签订合同时未按照公司章程规定经过内部审批程序。在此情况下，甲可以主张乙的程序违规导致合同效力存在问题（如乙无权代表公司签订合同），或者主张乙因程序违规而构成违约，要求乙承担违约责任。具体后果取决于合同的具体内容、程序违规的性质和程度以及相关法律法规的规定。

针对程序违规的建议：

• 在签订合同时，务必确保合同内容合法合规，并按照法定形式和程序进行签订。对于需要审批或登记的合同，应及时办理相关手续。
• 在合同履行过程中，应严格遵守合同约定和法律法规的规定，避免出现程序违规行为。如发现对方存在程序违规行为，应及时提出异议并保留相关证据。
• 如发生合同纠纷，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并根据具体情况选择合适的纠纷解决方式。

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