法人变更和股权变更确实可以一起办理，但这两项变更各自遵循独立的流程，并需分别提交相应的申请材料。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律依据
根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》以及《中华人民共和国公司法》等相关法律规定，公司的法人变更和股权变更均属于公司登记事项的变更范畴。法律并未禁止这两项变更同时进行，只要符合法定条件和程序，即可一并申请办理。
二、实际操作流程
内部决策：
- 公司需通过股东会或董事会的决议，明确变更的法人代表和股东结构。这一步骤是确保变更符合公司章程和内部管理规定的关键。
准备材料：
- 法人变更所需材料：通常包括法定代表人签署的《公司变更登记申请书》、关于变更法人的股东会决议或董事会决议、新法定代表人的任职文件和身份证明等。
- 股权变更所需材料：包括股权转让协议、股东会决议、新股东的主体资格证明或自然人身份证明等。
- 尽管两者所需材料有所不同，但可以整合准备，以便同时提交。
提交申请：
- 将准备好的材料提交至当地的市场监督管理部门（原工商行政管理部门）。提交方式可能因地区而异，有的地方支持线上办理，通过政务服务平台上传材料；有的地方则需线下前往政务服务大厅的市场监管窗口递交纸质材料。
- 需要注意的是，部分地方可能会要求分开填写申请表格，因此在提交前需咨询当地市场监督管理部门的具体要求。
审核与登记：
- 市场监督管理部门会对提交的材料进行审核。如果材料齐全、符合法定形式，就会予以受理，并在规定的时间内完成变更登记手续，换发新的营业执照。
三、注意事项
债权债务处理：
- 在进行法人变更和股权变更时，应特别注意公司债权债务的处理问题。新老股东需对公司的债权债务情况进行明确约定，以避免日后产生纠纷。
税务申报：
- 股权变更可能涉及个人所得税或企业所得税的缴纳问题。因此，在办理变更登记前后，需按照税法规定及时进行税务申报和缴纳。
法律咨询：
- 由于法人变更和股权变更涉及的法律问题较为复杂，建议在办理过程中寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、协助准备材料、参与谈判等，以确保流程的顺利进行和合法权益的保护。
材料准备的完整性：
- 无论是法人变更还是股权变更，都需要提交一系列的材料。这些材料必须完整、准确、符合法定形式。否则，可能会导致变更申请被驳回或延迟审批。
综上所述，法人变更和股权变更可以一起办理，但需分别准备材料并遵循当地法律法规的要求。在实际操作中，应咨询当地市场监督管理部门的具体流程和要求，并寻求专业律师的法律咨询和帮助，以确保变更的顺利进行。