针对农村侵占他人土地的问题，这是一个涉及法律权益和邻里关系的复杂情况，需要综合考虑多种因素来寻求解决方案。以下是我为您整理的一份详细且有条理的处理指南：

一、明确土地权属

首先，您需要确认自己对争议土地的合法权属。这可以通过查阅土地权证、承包合同或政府登记资料来实现。明确权属是解决问题的前提，也是后续采取任何措施的法律依据。

二、尝试友好协商

1. 直接沟通：在确认权属后，尝试与占用人进行友好沟通，了解其占用土地的原因和意图。
2. 表达诉求：明确表达自己对土地权益的诉求，如要求停止侵占、返还土地或支付土地使用费等。
3. 形成记录：建议将协商过程和结果形成书面记录，双方签字确认，以防日后纠纷。

三、申请调解

如果协商不成，您可以考虑向以下机构申请调解：

1. 村（居）委会：作为基层自治组织，村（居）委会具有公信力和协调能力，能够促使双方达成和解协议。
2. 乡镇人民政府：乡镇人民政府设有专门的农业农村部门或司法所等机构，具备专业的知识和处理此类问题的经验，能够依据相关法律法规和政策公正地处理纠纷。

四、行政处理

对于非法占用土地的行为，您有权向当地的土地行政管理部门（如自然资源局）举报。土地行政管理部门将依法对非法占地行为进行调查和处理，包括：

1. 认定非法占地行为：通过调查取证，确认占用人是否非法占用了您的土地。
2. 责令整改：要求占用人停止侵占行为，返还土地或采取其他补救措施。
3. 行政处罚：如果违法占用的土地上新建了建筑物和其他设施，土地行政管理部门将根据土地利用总体规划作出相应处理，如限期拆除、没收建筑物并处罚款等。

五、法律诉讼

如果通过上述途径都无法解决纠纷，您可以考虑向人民法院提起诉讼以维护自己的合法权益。根据纠纷性质的不同，您可以选择提起民事诉讼或行政诉讼：

1. 民事诉讼：适用于平等主体间的土地侵权纠纷，如个人与个人、个人与农村集体经济组织之间的纠纷。您可以要求侵占方停止侵害、排除妨碍、返还土地、赔偿损失等。
2. 行政诉讼：如果您认为行政机关在土地管理过程中作出的具体行政行为侵犯了自己的合法权益，如对土地确权决定或行政处罚决定不服，您可以向人民法院提起行政诉讼，请求法院撤销或变更该行政行为。

六、加强预防与管理

为了避免类似问题的再次发生，建议您在平时加强土地管理，定期检查土地使用情况，及时发现并处理潜在的侵占行为。同时，与邻居建立良好的关系，共同维护土地权益，也是预防土地纠纷的有效措施。

综上所述，处理农村侵占他人土地的问题需要综合考虑多种因素，包括土地权属的明确性、占用人的具体情况、法律法规的适用性以及社会关系的和谐性等。通过明确权属、积极沟通、寻求调解、依法举报和提起诉讼等多种途径，您可以有效地解决这一问题并保护自己的合法权益。