违法建设由规划部门认定的法律依据主要涉及城乡规划、土地管理及其他相关法律法规，具体认定部门和依据如下：

1. 城乡规划主管部门

   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
   • 职责范围：城乡规划主管部门负责城市规划区内违法建筑的认定，包括未批先建、超面积建设等行为。例如，在城市规划区内未经批准擅自搭建的建筑物、构筑物，或者虽然取得了规划许可但未按许可规定建设的，均由城乡规划主管部门进行认定和处理。

2. 乡镇人民政府

   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条，在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。
   • 职责范围：乡镇人民政府针对农村集体土地上未经审批擅自搭建的建筑物、构筑物进行认定。例如，在农村地区，村民未经批准擅自建设的住宅、仓库等建筑物，由乡镇人民政府负责认定和处理。

3. 其他相关部门

   • 自然资源部门：对涉及非法占用土地（如耕地、林地）的违建行为进行查处，依据《土地管理法》第七十七条追究法律责任。例如，未经批准擅自将农用地改为建设用地的，由自然资源部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状。
   • 住房和城乡建设部门：参与认定违反施工许可管理规定的建设项目，例如未办理施工许可证擅自开工的工程。虽然住房和城乡建设部门不直接认定违法建筑，但在施工许可管理方面发挥着重要作用，对于未取得施工许可擅自施工的项目，可以配合其他部门进行查处。

在违法建筑的认定过程中，一般遵循以下流程：

• 线索发现：通过群众举报、日常巡查、卫片执法等途径获取疑似违建信息。
• 调查取证：现场勘查核实建筑位置、面积、用途等基础数据，调取用地审批文件、规划许可证明等材料。
• 联合认定：复杂案件需多部门协同研判，例如自然资源部门确认土地性质，城管部门评估建筑安全性。
• 公示告知：将认定结果向社会公开，保障当事人陈述申辩权利。

对于违法建筑的认定，还需要注意以下几点：

• 历史遗留问题：部分早期建设的无证房屋可能因政策调整被纳入合法化范畴，需结合当地专项整治方案确定处理方式。例如，一些地区对于历史遗留的无证房屋，在符合一定条件的情况下，可以补办相关手续，使其合法化。
• 跨区域违建：跨行政区域的违法建筑由共同上级政府指定管辖机关，避免推诿扯皮。例如，对于跨市、跨县的违法建筑，由共同的上级政府指定某个部门或地区进行管辖和处理。

如果您对违法建筑的认定有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。 我将根据您的具体情况，提供详细的法律解释和建议。