开车门时不慎碰到别人的车辆，并在其车门上留下痕迹，这种情况下保险是否会进行赔偿，主要取决于事故责任是否明确以及是否属于保险的免责情形。在符合一定条件下，保险是可以进行赔偿的。以下是对此问题的详细解答：
一、保险赔偿的基础与法律依据
根据《机动车交通事故责任强制保险条例》的相关规定，被保险机动车发生道路交通事故，造成本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡或财产损失的，保险公司需在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内进行赔偿。当然，如果损失是由受害人故意造成的，保险公司则不予赔偿。在您所描述的情况下，开车门导致的车辆损失一般属于保险赔偿范围，除非对方故意碰撞。
二、交强险的赔偿情况
赔偿范围：交强险是强制保险，只要被保险车辆在交通事故中负有责任，无论责任大小，对于造成的对方车辆损失，交强险都会进行赔偿。
赔偿限额：交强险的财产损失赔偿限额为2000元。如果开车门碰别人车导致的损失在此限额内，交强险可以全额赔偿；超出部分则需要依赖其他保险进行赔付。
三、商业险的赔偿情况
车损险：如果您购买了车损险，且在开车门时自己的车辆也受损，那么维修费用可以通过车损险进行赔偿。
第三者责任险：如果您购买了第三者责任险，且开车门导致对方车辆损失超过交强险的赔偿限额，剩余部分可以根据事故责任划分，在第三者责任险的赔偿限额内进行赔付。
四、赔偿流程
保护现场/拍照留证：事故发生后，应立即保护现场或拍照记录，以便后续定损和理赔。
及时报案：向保险公司报案，说明事故情况，包括时间、地点、事故经过等。
查勘定损：保险公司会派遣人员查勘现场并定损，确定损失金额和维修方案。
提交赔偿申请：携带相关证件和材料（如行驶证、驾驶证、事故证明等）前往保险公司提交赔偿申请。
审核与赔偿：保险公司审核通过后，将按照定损金额在保险责任限额内进行赔偿。
五、免赔与特殊情况
免赔情形：如果存在故意破坏现场、伪造证据、未取得驾驶资格、醉酒驾驶等违法行为，保险公司通常会拒赔。同时，部分保险合同可能设有免赔额或免赔率，需要注意。
特殊情况处理：如果车辆停放位置不当导致的事故，保险公司可能会以违反安全注意义务为由拒赔。另外，如果是在正常停车情况下被他人开门导致受损，且对方有过错，保险公司应承担赔偿责任。
六、总结与建议
综上所述，开车门碰到别人车后，只要符合保险条款规定和法定程序，保险公司是会进行赔偿的。但具体赔偿情况需根据保险合同约定及事故具体情况判断。因此，建议您在购买保险时仔细阅读合同条款，了解保险范围和免责情形。同时，在发生事故后应保持冷静，按照正确流程处理，以确保自身权益得到保障。如果对方车辆损失较大或存在争议，建议及时报警并寻求专业法律帮助。