事业单位在与劳动者建立劳动关系时，确实需要签订相应的协议，但具体类型取决于劳动者的身份和岗位性质。以下是对这一问题的详细分析：
一、编制内人员：签订聘用合同
法律依据：
- 根据《事业单位人事管理条例》及相关规定，事业单位与编制内人员建立的是人事关系，而非普通的劳动关系。因此，他们之间签订的是聘用合同，而非劳动合同。
- 聘用合同是事业单位与工作人员在平等自愿、协商一致的基础上，通过签订聘用合同，明确聘用单位和受聘人员与工作有关的权利和义务的协议。
合同内容：
- 聘用合同一般包括聘用期限、岗位及其职责要求、岗位纪律、工资待遇、社会保险等方面的内容。
- 合同期限一般不低于3年，初次就业的工作人员与事业单位订立的聘用合同期限3年以上的，试用期为12个月。
二、编制外人员：签订劳动合同
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第二条的规定，国家机关、事业单位、社会团体和与其建立劳动关系的劳动者，订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，依照本法执行。
- 这意味着，对于没有事业单位编制的人员，如临时工、劳务派遣工等，事业单位应当与他们签订劳动合同。
合同内容：
- 劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。
- 它规定了劳动者的工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬、社会保险等事项，确保劳动者的权益得到保障。
三、签订协议的重要性
明确权利义务：
- 无论是聘用合同还是劳动合同，都是明确双方权利义务的重要法律文件。它们有助于构建稳定和谐的劳动关系，减少劳动争议的发生。
解决纠纷依据：
- 在发生劳动争议时，这些合同是解决纠纷的重要依据。它们提供了双方权利和义务的具体内容，有助于公正、公平地解决争议。
法律责任：
- 用人单位未按规定签订聘用合同或劳动合同，可能面临法律责任和风险。例如，未签劳动合同的，劳动者有权要求用人单位从第二个月开始支付双倍工资（最多11个月）。
四、建议与注意事项
及时签订合同：
- 事业单位应在新员工入职一个月内与其签订聘用合同或劳动合同，以避免法律风险。
合同内容合法合规：
- 无论是聘用合同还是劳动合同，都应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。合同内容应当明确、具体，不得违反法律法规的强制性规定。
加强合同管理：
- 事业单位应建立健全合同管理制度，对合同的签订、履行、变更、解除和终止等环节进行规范管理。同时，要加强对合同执行情况的监督检查，确保合同得到有效执行。
总结来说，事业单位在与劳动者建立劳动关系时，需要根据劳动者的身份和岗位性质签订相应的协议。对于编制内人员，签订聘用合同；对于编制外人员，签订劳动合同。这是依法保障劳动者权益、明确双方权利义务以及维护事业单位正常运作的必要措施。如果您在事业单位工作或即将与事业单位建立劳动关系，并对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。