法院对设有二次抵押（二抵）的房产执行时，会遵循法定程序，综合考量抵押权顺位、债权人利益及被执行人权益，具体执行方式如下：

1. 拍卖或变卖房产
   法院可依法对二抵房产进行拍卖或变卖，所得价款按抵押权登记顺序清偿债务。根据《民法典》第414条，同一财产向两个以上债权人抵押的，拍卖、变卖抵押财产所得价款依照登记时间先后顺序清偿。例如：

   • 若一抵债权为500万元，二抵债权为300万元，房产拍卖得款800万元，则一抵债权人优先受偿500万元，剩余300万元清偿二抵债权；
     
   • 若拍卖得款不足500万元（如仅400万元），则一抵债权人优先受偿400万元，二抵债权人无法获得清偿。

2. 协商以物抵债
   若债权人同意，法院可组织双方协商将房产作价抵偿债务。根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中拍卖、变卖财产的规定》第16条，协商不成的，法院应强制拍卖。协商时需注意：

   • 抵债价格需经双方认可，或由评估机构确定合理价值；
     
   • 需优先保障一抵债权人权益，剩余价值方可用于清偿二抵债务。

3. 参与分配程序（被执行人为自然人或其他组织时）
   若被执行人财产不足以清偿全部债务，且存在多个债权人，法院会启动参与分配程序。根据《民事诉讼法解释》第508条，普通债权人可按比例受偿，但抵押权人仍优先于普通债权人。例如：

   • 房产拍卖得款800万元，一抵债权500万元、二抵债权300万元、普通债权200万元，则一抵、二抵债权人全额受偿，普通债权人无法获偿；
     
   • 若拍卖得款600万元，则一抵债权人受偿500万元，二抵债权人受偿100万元，普通债权人无分配权。

4. 执行异议与救济

   • 抵押权人异议：若法院执行行为损害抵押权（如未优先清偿一抵债权），抵押权人可依据《民事诉讼法》第232条提出执行异议；
     
   • 被执行人异议：若认为执行标的非本人财产或存在其他权利障碍，可依据《民事诉讼法》第234条提出案外人异议。

实务建议：

1. 对债权人而言，需及时申请财产保全，确保执行优先权；
   
2. 对被执行人而言，若认为执行行为违法，可依法提出异议或申请再审；
   
3. 涉及企业为被执行人时，需注意《企业破产法》与执行程序的衔接，避免程序冲突。
   

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