履约保函原件丢失后，应立即采取以下措施以降低风险并保障自身权益：

1. 第一时间联系出具保函的银行或金融机构
   立即告知保函出具方保函原件丢失的情况，要求其出具书面说明或补办保函。银行通常会根据内部流程，要求申请人提供丢失声明（可能需公证）、补办申请书等材料，并可能收取一定手续费。
   关键点：银行出具的书面说明可证明原保函失效，避免被他人恶意使用；补办的新保函需明确标注“替代原保函”及生效日期。

2. 向受益人（如项目业主、合作方）通报情况并协商解决方案
   书面通知受益人保函丢失的事实，并提供银行出具的丢失证明或补办说明。根据合同约定，协商是否接受补办的保函或采取其他担保方式（如现金保证金、第三方担保）。
   风险提示：若未及时通知，受益人可能依据原保函向银行索赔，导致申请人承担双重责任。

3. 核查合同条款及保函约定
   仔细审查合同中关于保函丢失、补办、责任承担的条款。例如，部分合同可能约定“保函丢失后申请人需立即补办，否则视为违约”，或“银行仅对原件有效，复印件无效”。
   操作建议：若合同无明确约定，可引用《民法典》中关于“担保物权”的规定，主张原保函因丢失而失效，新保函为唯一有效担保。

4. 考虑登报声明或公证丢失（视银行要求而定）
   部分银行可能要求申请人在省级以上报纸刊登丢失声明，或到公证处办理保函丢失公证，以增强证明效力。
   注意：登报声明需包含保函编号、出具银行、丢失时间等关键信息，并保留刊登原件作为证据。

5. 评估风险并准备应急方案
   若保函已进入索赔期（如项目竣工后），需立即与银行、受益人沟通，防止恶意索赔。必要时可要求银行冻结原保函项下权益，或通过法律途径主张保函失效。
   极端情况处理：若保函被他人冒用，立即报警并留存报警回执，作为后续维权证据。

总结：履约保函丢失后，核心是“快速反应+证据固定+协商补办”。建议优先联系银行和受益人，同步推进补办流程和合同协商，避免因延误导致损失扩大。如有复杂情况（如涉及跨境保函、大额担保），可进一步向我咨询具体操作细节。