工程尾款超过三年仍然可以起诉，但需注意诉讼时效及其中断、延长的规定。以下是对这一问题的详细分析：

一、诉讼时效的基本规定

在我国，《民法典》明确规定了民事诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果债权人在三年内未向债务人主张权利，那么三年后，债务人可能获得诉讼时效抗辩权，可以在法庭上主张诉讼已过时效期间，从而拒绝履行债务。但这并不意味着债权人就完全失去了追讨工程款的权利，因为即便诉讼时效届满，债权人依然有权向法院提起诉讼，法院会受理该案件。

二、诉讼时效的中断与延长

在诉讼过程中，如果对方以诉讼时效已过进行抗辩，并且法院查明不存在诉讼时效中止、中断等法定情形，债权人可能会丧失胜诉权。然而，存在多种情况可以导致诉讼时效的中断或延长：

1. 债权人在三年内向债务人主张过权利：这包括通过书面催款函、短信、邮件等方式明确要求对方支付工程款。这些行为都能够证明债权人并未放弃自己的权利，从而使诉讼时效重新计算。
2. 债务人同意履行义务：如债务人作出还款承诺或实际部分履行等，这也能够导致诉讼时效的中断。
3. 债权人提起诉讼或者申请仲裁：这些法律行为同样能够中断诉讼时效，使得新的诉讼时效期间从相关程序终结时开始计算。

此外，如果债权人能提供证据证明自己确实不知道权利被侵害，或者因为其他客观原因不能行使权利，法院也可能根据申请延长诉讼时效。

三、实际建议

1. 及时收集证据：包括合同、结算单、催款记录、对方的还款承诺等，以证明债权的存在和诉讼时效的中断情况。这些证据在诉讼过程中至关重要，能够支持你的主张并反驳对方的抗辩。
2. 做好应诉准备：特别是针对债务人可能提出的诉讼时效抗辩，要准备好相应的反驳证据和法律依据。你可以咨询我，谭成喜律师，以更好地了解法律规定和诉讼策略，提高胜诉的可能性。
3. 关注诉讼时效的动态变化：在追讨工程款的过程中，要密切关注诉讼时效的动态变化。如果发现诉讼时效即将届满，应及时采取措施中断诉讼时效，如再次催款或提起诉讼等。

四、法律后果

如果债权人未能在诉讼时效期间内主张权利，且不存在诉讼时效中断或延长的情形，那么当债务人提出诉讼时效抗辩时，法院可能会驳回债权人的诉讼请求。这意味着债权人将无法通过法律强制手段要求对方支付工程款。因此，及时主张权利并关注诉讼时效的动态变化至关重要。

综上所述，虽然工程尾款欠款时间已超过三年，但债权人依然有权利通过法律途径来追讨。关键在于准备好充分的证据，并了解并应用好诉讼时效的相关规定。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。