结论：若您已认罚空车超重被罚5万这一处罚，可按以下步骤处理：先确认处罚主体与依据，再核查处罚程序合法性，若均无误则按要求缴纳罚款；若存在疑问，可申请行政复议或提起行政诉讼。以下为详细分析：

1. 确认处罚主体与依据

   • 主体合法性：首先要确认作出该处罚决定的主体是否具有相应的行政处罚权。例如，对于交通运输领域的超重处罚，通常是由交通运输管理部门，如交通运输综合行政执法机构等负责。如果作出处罚的主体不具有相应权限，那么该处罚决定可能存在合法性问题。
   • 依据准确性：查看处罚决定所依据的法律法规是否准确。在我国，对于车辆超重的处罚依据主要是《中华人民共和国道路交通安全法》《中华人民共和国公路法》等相关法律法规。不同的超重情形、不同的道路类型等，适用的法律条款和处罚标准可能不同。比如，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条规定，货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款。如果处罚5万明显超出法定标准，那么该处罚依据就存在问题。

2. 核查处罚程序合法性

   • 调查取证程序：行政机关在作出处罚决定前，应当进行充分的调查取证，收集能够证明车辆超重事实的证据，如称重记录、现场照片、询问笔录等。您有权要求行政机关出示这些证据，以确认其调查取证程序是否合法。如果行政机关在调查取证过程中存在程序违法，如未依法进行称重、未制作询问笔录等，那么该处罚决定可能因程序违法而被撤销。
   • 告知与听证程序：根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，行政机关在作出较大数额罚款等行政处罚决定之前，应当告知当事人有要求举行听证的权利；当事人要求听证的，行政机关应当组织听证。这里的“较大数额罚款”，不同地区有不同的标准，一般在地方性法规或者规章中会有明确规定。如果行政机关未依法履行告知义务或者未组织听证，而您又符合要求听证的条件，那么该处罚决定可能因程序违法而被撤销。

3. 缴纳罚款

   • 如果经过上述核查，确认处罚主体合法、依据准确、程序合法，那么您应当按照处罚决定书的要求，在规定的期限内到指定的银行缴纳罚款。逾期不缴纳罚款的，每日按罚款数额的百分之三加处罚款，加处罚款的数额不得超出罚款的数额。同时，行政机关还可以申请人民法院强制执行。

4. 申请行政复议或提起行政诉讼

   • 行政复议：如果您对处罚决定不服，可以在知道该处罚决定之日起六十日内向作出处罚决定的行政机关的上一级主管部门或者本级人民政府申请行政复议。行政复议机关会对处罚决定的合法性和合理性进行审查，并作出行政复议决定。如果行政复议决定维持了原处罚决定，您仍然不服的，可以在收到行政复议决定书之日起十五日内向人民法院提起行政诉讼。
   • 行政诉讼：您也可以直接在知道作出处罚决定之日起六个月内向人民法院提起行政诉讼。人民法院会对行政机关的处罚行为进行全面审查，包括主体资格、法律依据、程序合法性等方面。如果人民法院认为处罚决定违法，会判决撤销或者部分撤销该处罚决定，并可以判决行政机关重新作出行政行为或者赔偿您的损失。