刑事案件不予起诉，在严格意义上通常不会留下犯罪记录即案底，但具体情况需根据不起诉的类型及案情来具体分析。以下是对不同类型不起诉情况及其对案底影响的详细分析：

1. 法定不起诉：

   • 情形：包括情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。
   • 结果：在这些情形下，人民检察院将作出不起诉决定，因为行为人本质上未构成犯罪或不应被追究刑事责任，所以不会留下案底。

2. 酌定不起诉：

   • 情形：犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。
   • 结果：尽管犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，但检察机关综合考虑各种情节后认为无需判处刑罚，因此作出不起诉决定。这种情况下同样不会留下严格意义上的案底。然而，值得注意的是，酌定不起诉的案件在公安机关内部系统可能会有相关记载，这些记载虽然不构成案底，但可能对当事人的生活产生一定影响，如影响某些职业的入职审查等。不过，目前部分地区对于符合特定条件的酌定不起诉案件，会探索进行案底封存等特殊处理方式，以减少对当事人的不利影响。

3. 证据不足不起诉：

   • 情形：对于二次补充侦查的案件，如果人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
   • 结果：由于现有证据无法证明犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，法律上不能认定其有罪，因此不会留下案底。但若后续发现新证据足以证明其有罪，仍可能提起公诉并留下案底。

特殊情况说明：

• 司法机关内部记录：虽然不起诉通常不会留下案底，但相关记录可能存在于公安机关或检察机关的档案中。这些记录并不等同于案底，且通常不会对个人生活和工作产生直接影响，但在特定情况下（如涉及国家安全、重大公共利益等）可能会被查询或审查。
• 行政处罚或其他处分：即使检察院作出不起诉决定，但如果认为犯罪嫌疑人存在犯罪事实且情节显著轻微危害不大，虽然不会给予刑事处罚，但可能会给予行政处罚或其他处分。此时，通常会留有相应的记录，但这不属于传统意义上的“案底”。

总结与建议： 刑事案件不予起诉是否会留下案底，主要取决于人民检察院的不起诉决定类型以及具体的案情。在大多数情况下，不予起诉不会留下严格意义上的案底，但可能存在某些特殊记录或影响。因此，在处理刑事案件时，应谨慎对待每一步程序，确保公正、合法地维护当事人的权益。如果您或您身边的人遇到类似情况，建议及时咨询专业律师以获取更详细的法律指导和帮助。