刑事案件法院不起诉，一般情况下不会留下案底，但具体还需根据不起诉的类型及案情来判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、不起诉的类型及是否留案底
法定不起诉（绝对不起诉）
- 情形：包括情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。
- 是否留案底：在这些情形下，由于犯罪嫌疑人的行为不被认定为犯罪或依法不需追究刑事责任，因此不会留下案底。
酌定不起诉（相对不起诉）
- 情形：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
- 是否留案底：尽管行为构成犯罪，但因情节轻微等原因不需判处刑罚，检察院作出酌定不起诉后，通常也不会留下案底。不过，部分地区对于符合特定条件的酌定不起诉案件，可能会探索进行案底封存等特殊处理方式，以减少对当事人的不利影响。
证据不足不起诉
- 情形：经过补充侦查后，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
- 是否留案底：因证据不足而无法认定犯罪嫌疑人有罪，故不会留下案底。但如果后续发现新的证据，符合起诉条件时，仍可能提起公诉。
二、特殊情况与注意事项
- 行政违法记录：虽然检察院的不起诉决定本身不产生犯罪记录，但若行为涉及行政违法，可能会留下行政处罚记录。例如，因打架斗殴被检察院不起诉，但可能因违反《治安管理处罚法》而受到行政处罚，留下行政处罚记录。
- 特定行业或职业影响：在某些行业或职业中，即使检察院作出不起诉决定，相关单位可能根据内部规定进行一定处理或记录。例如，教师因涉嫌犯罪被检察院不起诉，但学校可能根据内部规定对其进行纪律处分或记录。
- 后续情况变化：若后续出现新证据或情况发生变化，导致案件重新进入司法程序并被法院判决有罪，则将留下犯罪记录。
三、建议与总结
- 了解不起诉类型：在接到检察院的不起诉决定后，应了解具体的不起诉类型，以便判断是否会留下案底。
- 咨询专业律师：如有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更准确的法律意见和帮助。
- 关注后续影响：即使检察院作出不起诉决定，也应关注可能涉及的行政违法记录、特定行业或职业影响以及后续情况变化等，确保自身权益得到充分保障。
总之，刑事案件法院不起诉是否会留下案底，主要取决于人民检察院的不起诉决定类型以及具体的案情。如有任何疑问或需要更详细的法律咨询，请直接向我提问。