在刑事案件中，如果发现遗漏了被告（即犯罪嫌疑人），这是一个需要严肃对待的程序问题，因为它直接关系到司法的公正性、全面性以及被害人的合法权益。以下是对这一问题的详细解答：

一、发现遗漏被告的阶段及应对措施

1. 侦查阶段：

   • 发现问题：公安机关在侦查过程中，若发现有遗漏的犯罪嫌疑人，应立即启动补充侦查程序。
   • 处理方式：公安机关会进一步调查取证、询问证人、分析线索，以全面收集与遗漏嫌疑人有关的证据和信息。证据确凿后，将其与其他已查明的犯罪嫌疑人一并移送人民检察院审查起诉。

2. 审查起诉阶段：

   • 检察院发现：人民检察院在审查案件材料时，若发现遗漏犯罪嫌疑人，可要求公安机关补充移送审查起诉；若犯罪事实清楚，证据确实、充分，也可直接提起公诉。
   • 辩护人或犯罪嫌疑人提出：辩护人或犯罪嫌疑人若发现遗漏共同犯罪人，有权向检察院提出意见，并提供相关线索和证据。检察院会核实并处理这些意见。
   • 补充侦查：人民检察院应制作补充侦查提纲，连同案卷材料一并退回公安机关进行补充侦查，必要时可自行侦查并要求公安机关协助。

3. 审判阶段：

   • 法院发现：人民法院在审理过程中，若发现遗漏犯罪嫌疑人，通常会建议人民检察院补充或变更起诉，而不会自行追加被告人。
   • 公诉人发现：公诉人在法庭审理中发现遗漏罪行或同案犯罪嫌疑人时，应要求法庭延期审理，以便进行补充侦查或提供证据。

二、补充侦查的相关规定

• 时间限制：补充侦查应在一个月内完成，且最多不得超过两次。
• 侦查内容：公安机关应对遗漏的犯罪嫌疑人进行全面侦查，包括收集证据、讯问犯罪嫌疑人等，以确保案件事实清楚，证据确实充分。

三、审查起诉与审判阶段的特殊处理

1. 审查起诉：

   • 重新计算期限：补充侦查完毕后，人民检察院应重新计算审查起诉的期限。
   • 起诉决定：若经过补充侦查，人民检察院认为遗漏的犯罪事实清楚，证据确实充分，应依法对遗漏的犯罪嫌疑人提起公诉。

2. 审判阶段：

   • 法庭审理：人民法院对提起公诉的案件进行审查后，若起诉书中有明确的指控犯罪事实，应决定开庭审判。
   • 数罪并罚：若在法庭审理过程中发现被告人还有其他遗漏的罪行，法院应对数罪进行并罚，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，在总和刑期以下、数刑中最高刑期以上，酌情决定执行的刑期。

四、特殊情况的处理

• 故意遗漏：若司法机关工作人员故意遗漏犯罪嫌疑人，可能构成滥用职权、徇私枉法等犯罪，应依法追究其刑事责任。
• 申诉与再审：若遗漏的犯罪嫌疑人对案件定罪量刑有重大影响，且因未及时补充调查导致案件处理结果可能出现偏差，当事人可依法提出申诉或申请再审，以维护自身合法权益。

五、实际操作中的建议

• 及时沟通：在案件处理过程中，各司法机关之间应保持及时沟通，确保信息畅通，避免遗漏犯罪嫌疑人。
• 专业咨询：对于涉及复杂法律问题的案件，如数罪并罚的具体计算、追诉时效的适用等，建议咨询专业法律人士以确保处理的准确性。
• 积极配合：犯罪嫌疑人或被告人应积极配合司法机关的调查和审判工作，如实陈述案情，以便司法机关能够做出公正的处理决定。

综上所述，刑事案件中遗漏被告的处理是一个严谨而复杂的过程，需要司法机关严格按照法定程序进行侦查、审查起诉和审判，确保不遗漏任何应当被追究刑事责任的犯罪嫌疑人，从而维护司法的公正性和全面性。